Види в біоценозі утворюють і певну просторову стуктуру, особливо в його рослинної частини ¾ фитоценозе. Перш за все чітко визначається вертикальне ярусное будова в лісах помірного і тропічного поясів. Наприклад, в широколистяних лісах можна виділити п'ять - шість ярусів: перший ¾ дерева першої величини (дуб, липа, в'яз); другий ¾ дерева другої величини (горобина, яблуня, груша, черемха і ін.); третій ¾ підлісок чагарниковий (крушина, жимолость, бересклет і ін.); четвертий складається з високих трав, а п'ятий і шостий, відповідно, з більш низьких трав (рис. 4.2). Ярусність виражена в трав'янистих співтовариствах, але не настільки явно, як в лісах. Ярусність дозволяє рослинам повніше використовувати світловий потік ¾ в верхніх ярусах світлолюбні, в нижніх ¾ тіньовитривалі і в самому низу ¾ вловлюють залишок світла тіньолюбиві рослини.
Мал. 4.2 Яруси лісового біогеоценозу (по І. Н. Пономарьової, 1978)
У вертикальному напрямку під впливом рослинності змінюється мікросередовище, включаючи не тільки вирівняність і підвищення температури, але і зміна газового складу за рахунок зміни напрямку потоків вуглекислого газу вночі і вдень, виділення сірчистих газів хемосінтезірующімі бактеріями і т. П. Зміни мікросередовища сприяють утворенню і певної ярусности фауни ¾ від комах, птахів і до ссавців (див. рис. 4.2).
Крім ярусности в просторову структуру біоценозу спостерігається мозаїчність ¾ зміна рослинності і тваринного світу по горизонталі. Майданна мозаїчність залежить від різноманітності видів, кількісного їх взаємини, від мінливості ландшафтних і ґрунтових умов. Мозаїчність може виникнути і штучно ¾ в результаті вирубки лісів людиною. На вирубках формується нове співтовариство.
Видова структура біоценозів, просторовий розподіл видів в межах біотопу, багато в чому визначається взаємовідносинами між видами, між популяціями.