АФК інтегрує в собі як мінімум три великих області знання - фізичну культуру, медицину, корекційну педагогіку - і велика кількість навчальних і наукових дисциплін: теорію і методику ФК, теорію і методику окремих ВС і їх груп, теорію і методику ФВ, рухової рекреації і фізичної реабілітації; анатомію, фізіологію, біохімію, біомеханіку, гігієну, загальну і приватну патологію, тератологію, психологію хвороби та інвалідності, спеціальну психологію, спеціальну педагогіку, психіатрію, псіхоконсультірованіе і т.д.
Необхідність об'єднання в єдиний дослідний колектив представників ФК, медицини, корекційної педагогіки призводить до різних трактувань сутності АФК, що зумовлює науковими уподобаннями науковців, їх попереднім досвідом роботи.
Одним з найважливіших вимог сьогоднішнього дня є розробка методологічних основ АФК, фундаменталізація освіти в цій області.
Основна проблема тут полягає не в накопиченні і об'єднанні знань по ФК, медицині, корекційної педагогіки та великій кількості перерахованих раніше навчальних і наукових дисциплін, а в створенні, по суті, нового знання, який є собою результат взаємопроникнення знань кожної з названих областей і дисциплін. Завдання це надскладна, але саме її рішення дозволить розглянути людини з відхиленнями в стані здоров'я (в тому числі має ту чи іншу інвалідність) цілісно; долати так званий дихотомічний підхід до вивчення його сутності, коли він «розчленовується» на окремі субстанції конкретних наук.