Цетіньській монастир розташований в центрі старої столиці Чорногорії м Цетіньє, біля підніжжя гори Орлиний Хрест. Від самого свого заснування, ось вже більше 500 років, монастир є резиденцією чорногорських митрополитів. Без жодного перебільшення його можна назвати серцем православної Чорногорії, її символом і колискою її знаменитого волелюбного духу.
Заснував монастир господар Іван Черноєвіч - Іван-бег - правив Зетой, як за старих часів називалася Чорногорія, в 1465-1490 роках. У 1479 році турецький султан Мехмет II захопив Зету, а Іван був змушений ховатися в Італії. Тут він відвідав Лоретскій монастир Божої Матері в Анконі, де дав обітницю побудувати церкву, присвячену Богородиці, в разі свого повернення на батьківщину. У 1481 році, коли Мехмет II помер, Іван Черноєвіч повертається в Зету і знов знаходить владу над цими краями. Залишивши свою резиденцію на Жабляке на Скадарском озері, Іван-бег 1484 року будує собі палац і «задужбину» - Цетіньській монастир - в неприступному для турків ловченском підгір'я. За згодою з тодішнім зетського митрополитом Виссарионом, вікарним єпископом Вавилов і всієї братією Іван встановлює чернецький статут монастиря. Сюди, з монастиря Враньина переноситься резиденція зетського єпархії, заснованої Свт. Савою I в 1219 році. У своїй грамоті Іван Черногевіч щедро наділив свою «задужбину» землями, лісовими угіддями і всім необхідним.
Обитель перебувала на пагорбі Чіпур. За свідченням сучасників це був «малий, але прекрасний» монастир. В середині його стояла церква Різдва Пресвятої Богородиці, оточена з трьох сторін колонадою. Імовірно храм будували майстри з Примор'я. По краях ділянки стояли монастирські будівлі: мала церква св. ап. Петра, келії, митрополичі покої і господарський будівлі. У зовнішніх стінах цих будівель були бійниці, а весь монастир був оперезаний ровом і огорожею з кілків.
Іван Черноєвіч помер в 1490 році і був похований в церкві монастиря, біля південної стіни. Його останки були знайдені при археологічних розкопках 1980-х роках. Син Івана - Георгій, який керував Зетой в 1490-1496 роках, заснував в 1494 році першу на слов'янському півдні друкарню на Ободі, але незабаром переніс її в Цетіньській монастир. Тут були віддруковані Октоїх первогласник 1494 році, Октоїх пятогласнік з прекрасними ілюстраціями-видами Іван-бігові монастиря, Псалтир з последованием, Молитвослов, Четвероєвангеліє. Першим друкарем був схііеромонах Макарій.
Під натиском турків Георгій Черноєвіч змушений був тікати до Венеції, а Чорногорією деякий час (1496-1499 роках) правил, як турецького васала, його молодший брат Стефан. Після цього країна потрапляє під пряме турецьке правління, а чорногорські владики стають не тільки духовними, а й світськими вождями свого народу, невпинно працюючи над його звільненням.
Переломним моментом в історії Чорногорії стало обрання митрополитом і господарем 27-річного цетінського ченця Данила (Петровича) з села Негуши. Владика Даниїл став першим чорногорським правителем з династії Петровичей-Негошей, яка володіла Чорногорією до 1916р. (Офіційно до 1918) Митрополичий, а потім княжий престол став спадковим в цій сім'ї, переходячи від дядька до племінника. У 1701-1704 митрополит Данило відродив Цетіньській монастир на новому місці, на схилі гори Орлиний Хрест. При будівництві нового монастиря використовувалися будівельні матеріали зі зруйнованого. У вівтарну стіну нової церкви був вправлений кам'яний рельєф з двоголовим орлом - гербом Івана Черноевіча, над входом встановлена стара плита з текстом про заснування обителі, а колони аркади 2-го поверху прикрасили старі різьблені капітелі.
Світ, вставай за Хрест, за честь юнатства,
всі, хто носить світле зброю,
всі, хто чує власне серце!
Ми поганців імені Христового
охрестимо водою або кров'ю!
У Божому стаді знищимо заразу!
Так взнесётся пісня фатальна,
вівтар правий на камінь кривавий!
(Петро II Петрович-Негош «Гірський вінець» переклад Ю. Кузнєцова, 1988)
Після смерті владики Данила Цетіньській кафедру в 1735-1781 займав його племінник митрополит Сава (Петрович-Негош), якому допомагав інший племінник владики Данила - Василь (Петрович-Негош), митрополит Скендерійскій і Приморський (1750-1766). У 1781-1784 чорногорським владикою був племінник митрополита Сави - Арсеній (Пламенац).
У 1784-1830 роках чорногорським митрополитом був Петро I (Петрович-Негош) - свт. Петро Цетіньській. У його відсутність (владика був у той час в Росії) в 1785 році відбулося останнє руйнація монастиря під час нападу Скадарського паші Махмуда Бушатлі. Через 11 років під час нового нападу на Чорногорію Махмуд-паша загинув в битві при с. Крус. Череп його, як військовий трофей, і зараз зберігається в Цетінському монастирі.
За часів його наступника, - знаменитого чорногорського поета і митрополита (1830-1851) Петра II (Петровича-Негоша), монастир значно розширюється. Завдяки отриманій з Росії допомоги надбудовується дворовий корпус і будується кухня з трапезної. Але монастирських будівель для всебічної діяльності чорногорського владики все одно було недостатньо. В цей час в монастирі працювали школа (заснована в 1834 році), друкарня (привезена Петром II в 1833 році з Росії, зупинялися іноземні гості і навіть титуловані особи. У 1838 році поряд з монастирем була побудована нова резиденція для Петра II.
У 1890-х роки до монастирської стіни зовні прилаштовується відкрита усипальниця правлячої династії. У 1896 році на верхньому ярусі вежі-дзвіниці влаштовуються годинник, а над ними - маленька дзвіниця.
У 1920-1938 роках чорногорським митрополитом був Гавриїл (Дожич), майбутній сербський патріарх (1938-1950). При ньому, в 1925-1927 роках в монастирі відбувається радикальна перебудова. Споруджена нова митрополича резиденція, вежа-дзвіниця отримала свій нинішній вигляд. У 1940-1945 роках Цетіньській кафедру займає майбутній священномученик Іоанникій (Липовац), який пережив тут італійську окупацію і втікши з Цетинья в 1944 році з 70 священиками від наступаючих тітовської загонів.
У 1947 році чорногорським митрополитом стає Арсеній (Брадаревіч) .В 1954 року Митрополит Арсеній із ще 7-ма чорногорськими священиками був засуджений Цетіньській судом на 11 з половиною років «за організацію змови проти народного режиму в Чорногорії і антидержавну діяльність». «Вина» владики полягала в тому, що він в 1945 році, будучи адміністратором Загребської митрополії, сказав, що католицька церква під час Другої світової війни зробила багато зла православному населенню Хорватії. Інший виною чорногорського митрополита було те, що він під час зустрічі з секретарем Всесвітньої Ради Церков Робертом Тобіасом, дав йому дані про те «як народні влади женуть Сербську Церкву». Після звільнення владики Арсенія, комуністична влада не дозволили йому повернутися в Цетіньє, і тоді в 1961 році на чорногорську кафедру був обраний Данило (Дайковіч). При ньому в 1984 році було побудовано нову будівлю митрополичої резиденції, а старе використано для розширення музейної експозиції Цетиньской ризниці.
Монастирська церква присвячена Різдву Пресвятої Богородиці. У цьому храмі знаходяться головні святині монастиря: ковчег з мощами свт. Петра Цетіньського, а на ньому - ковчег із десницею св. Іоанна Предтечі і Частка Чесного і Животворящого Хреста Господнього.
Іконостас в церкві дерев'яний, різьблений. Ікони написані Миколою Аспіоті з острова Корфу (за іншими даними - братами Джіновскі з Македонії). Цікаво, що на місці престольного образу - ікона свт. Петра Цетіньського (через що в деяких джерелах часто пишуть помилково, що церква присвячена цьому Святителю). У церкві знаходяться дві гробниці: у південної стіни - чорногорського князя (1852-1860) Данила I Петровича-Негоша, а біля північної стіни - його брата воєводи Мірко, за свої перемоги над турками прозваного «мечем Чорногорії».
У багатій ризниці-музеї монастиря виставлені корона cв. Стефана Дечанского, епітрахиль cв. Сави I, облачення чорногорських митрополитів і дари російських імператорів, а також цінне зібрання рукописних і друкованих книг XIII-XIX століть, наприклад рукописне Євангеліє Дівоша Тіхорадіча (близько 1350 року).
Між монастирем і палацом-музеєм чорногорського короля Миколи, на руїнах старого Іван-бігові монастиря, варто придворна церква Різдва Пресвятої Богородиці, приписана до Цетиньскому монастирю і є храмом Цетиньской семінарії. В церкви спочивають останки останнього чорногорського правителя короля Миколи (помер в 1921 році) і його дружини Мілени, перенесені сюди з російської церкви в Сан-Ремо (Італія) в 1989 році.
Цетіньській семінарія, де викладають багато цетиньские монахи, розташована неподалік від монастиря, в колишньому будівлю церковного суду. Поблизу від семінарії, на Негошевой вулиці, розташовуються журнал «Светигора» і православне радіо «Светигора», в редакціях яких також працюють цетиньские монахи.
Над монастирем, на вершині гори Орлиний Хрест, розташований мавзолей владики Данила, у вигляді відкритої каплиці. Звідси відкривається вид на гірський масив Ловчен, на одній з вершин якого, - на Єзерського врху (Озерному верху), похований видатний чорногорський митрополит і поет Петро II. Побудована їм як своєї усипальниці церква св. Петра Цетіньського була знесена безбожними тітовської владою в 1972 році, а на її місці споруджено потворний мавзолей.
Настоятель монастиря - ігумен Лука (Анич), магістр історії мистецтв. Братство монастиря зараз налічує більше десяти ченців і послушників.