Для усунення діареї (проносу) використовують адсорбенти, хороший ефект також дають антисекреторні препарати (блокатори протонної помпи. Блокатори Н2 гістамінових рецепторів). З огляду на, що діарея при хронічному ентериті обумовлена прискореної роботою кишечника, лопреамід (імодіум) виявляється досить ефективним засобом в боротьбі з діареєю.
Крім описаних препаратів, спрямованих на зменшення діареї, також непоганий ефект роблять заспокійливі засоби - транквілізатори.
Здуття живота і метеоризм добре усувають вітрогінні кошти, наприклад Еспумізан.
Широко використовується замісна терапія у вигляді призначення ферментів підшлункової залози (фестал, мезим, креон та ін.), Так як функція останньої часто порушується.
Велику увагу приділяють лікуванню дисбактеріозу, для чого призначаються пробіотики - препарати містять «корисні» бактерії, які, потрапивши в кишечник, заселяють його і конкурентно призводять до загибелі шкідливої флори.
При важкій формі перебігу хронічного ентериту з вираженим порушенням травлення і всмоктування, розладами водно-електролітного балансу, вдаються до інфузійної замісної терапії: панангин (або хлористий калій), глюконат кальцію, комплекс вітамінів групи В або полівітаміни, білковий гідролізат, препарати заліза. Можуть використовуватися також стероїдні гормони, які зменшують вираженість запалення в кишечнику і поліпшують його всмоктувальної функції.
Крім цього при вираженому виснаженні пацієнта можуть використовуватися анаболічні астроїди, це ті препарати, що використовують як допінг недобросовісні атлети. Анаболіки сприяють нарощуванню м'язової маси, покращують обмінні процеси і сприяють швидшому відновленню слизової кишечника.