* Підготовка фахівців з вищою освітою для органів фінансової поліції і митної служби.
* Підготовка фахівців з вищою освітою для органів фінансової поліції і митної служби;
* Перепідготовка та підвищення кваліфікації керівних кадрів і співробітників органів фінансової поліції і митної служби;
* Підготовка науково-педагогічних кадрів;
* Проведення науково-дослідних робіт з актуальних проблем боротьби з економічною і корупційною злочинністю.
Особливістю навчального процесу Академії, що відрізняє її від інших вузів країни, в тому числі і відомчих, є велика питома вага економічних дисциплін поряд з юридичними дисциплінами. Велика увага приділяється вивченню спеціальних курсів по слідчо-економічної та оперативно-економічної спеціалізації (методика розкриття і розслідування економічних і корупційних злочинів, кваліфікація злочинів в сфері економіки, організація виробництва попереднього розслідування та інші), стройової і вогневої підготовки.
У структурі Академії є окремий структурний підрозділ - Центр моніторингу та контролю якості освіти (центр тестування), який займається оцінкою рівня професійної готовності практичних працівників органів фінансової поліції і митної служби з різних напрямків професійної діяльності, забезпечує організацію всіх видів контролю знань, розрахунок академічного рейтингу слухачів академії, здійснює моніторинг якості підготовки слухачів. Все заліково-екзаменаційні сесії проходять в Центрі тестування в формі тестування без участі викладачів.
Практична спрямованість науково-дослідної діяльності знаходить своє вираження в підготовці різних розробок для органів фінансової поліції. Перед Академією завжди ставилося завдання щодо забезпечення оперативно-слідчого корпусу територіальних підрозділів розробками методичного характеру, що дозволяють виявляти, розкривати і розслідувати економічні злочини, за якими раніше кримінальні справи не порушувалися. Академія розробляє методичні рекомендації щодо розкриття та розслідування складних, замаскованих і важко виявляються економічних злочинів, що приносять найбільший збиток економіці держави. Всього за період існування Академії розроблено понад 60 методичних рекомендацій, які у вигляді збірок або окремо розсилалися в територіальні органи.
Крім того, розроблена методика визначення індексів корумпованості державних органів. Слід також відзначити такі підготовлені і направлені в Агентство розробки, як «Питання медіації в кримінальному процесі», пропозиції щодо ефективного використання результатів діяльності неурядових організацій, провідних соціологічні дослідження з проблем корупції, і багато інших.
Загальна та спеціальна бібліотеки Академії постійно поповнюються навчальної, наукової та художньої літературою, методичними розробками, виконаними викладачами Академії, інших вузів країни і країн ближнього і далекого зарубіжжя. Фонд загальної бібліотеки складають 94820 примірників, з них навчальної літератури - 81027 примірників, наукової літератури - 11657 примірників, іншої літератури - 2136 примірників. Фонд спеціальної бібліотеки становить 2166 одиниці. В Академії є Довідкова правова система «Юрист», активно функціонує доступ до всесвітньої мережі Інтернет.
В Академії є банно-пральний комплекс, гуртожитки оснащені душовими. Є автономна котельня для опалення та гарячого водопостачання, автогараж.
Розвиток співпраці Академії з вузами і науковими установами Казахстану та зарубіжжя є одним з пріоритетних напрямків і викликається необхідністю спільного протистояння транснаціональній злочинності, проведення спільних наукових досліджень з вивчення корупційної злочинності та криміногенної ситуації в сфері економіки.
Налагоджено зв'язки і триває активна співпраця Академії з Казахським гуманітарно-юридичним університетом, Гуманітарних університетом ім. Д. А. Конаева, Академією МВС РК, Академією КНБ РК, Карагандинському юридичним інститутом МВС РК ім. Б. Бейсенова, Костанайські юридичним інститутом КУІС МЮ РК, Карагандинському державним університетом ім. Е.А. Букетова, Казахським національним університетом ім. аль-Фарабі, Академією державної служби при Президентові РК і іншими.