Для зберігання яблук використовують дерев'яні та пластикові ящики, в основному прямокутної форми, місткістю до 25 кг. Хоча звичайно краще, якщо заготовлено яблук не дуже багато, зберігати їх в невеликих ящиках. Щоб яблучка доспіли через кілька тижнів після збору і залишалися соковитими і хрусткими їх краще викладати в один шар. Але для такого зберігання в прохолодному і вологому погребі з температурою 2-4 градуси, треба встановити спеціальні стелажі. Ящики краще зробити висувними і ці стелажі можна використовувати кілька років.
Не залежно від розмірів ящиків, вони повинні бути чисто вимиті, і оброблені препаратами, що містять мідь, приготувати розчин, так само як і для обробки садових дерев. Після обробки препаратом, через кілька днів ящики помити і просушити.
Яблука при зборі вже сортувати за розмірами, щоб зайвий раз не перекладати. Плоди яблук великого і середнього розміру зберігаються краще, ніж дрібні, незалежно від сорту. Яблука в ящики укладають рядами, паралельно торцях ящика. Плоди наступного ряду розкладають точно над плодами нижнього.
Застосовується шахова укладка яблук в ящики, при цьому кожен шар зсувається право або вліво на половину діаметра плоду. При такому укладанні плодоніжки яблук потрапляють в поглиблення між плодами, укладеними нижче, і не травмують шкірку яблук.
Після укладання ящики засипають шаром дрібної деревної стружки від листяних порід і накривають папером. Кожен ряд яблук можна також пересипати сухим торфом, лляними очосами.
Загортати яблука в газету? На практиці встановлено, що не всі сорти зимових яблук добре зберігаються загорнутими в газету, можна використовувати промаслений або пергаментний папір. Можна просочувати папір вазеліном і загортати яблука, особливо Антонівку, яка псуватися при зберіганні дивуючись «засмагою».
Для деяких сортів яблук досить прокласти папір між кожним рядом, це - Північний синап, Боровинка, Мільтош, Джонаред. Можна між рядами розсипати м'яку дрібну деревну стружку. Сорт яблук Джонатан, взагалі не вимагає прокладок, ці яблука при акуратною укладанні добре зберігається, без паперу.
У погребі чи підвалі ящики встановлюють на стелажі, нижня полиця на 20 см від підлоги. Вгорі між ящиками і стелею повинно залишатися не менше 40см. Між ящиками теж має бути невелика відстань для провітрювання і циркуляції повітря. При закладці яблук на зимове зберігання, треба враховувати, що у верхній частині сховища температура повітря вища, ніж в низу. Тому ящики з яблуками треба встановлювати так, щоб яблука, з тривалим зберіганням ставити нижче, а інші вище.
При зберіганні треба періодично оглядати яблука, видаляти гнилі, але якщо все нормально, краще яблука не турбувати, щоб не стирати восковий наліт.