«Козаки, - писав Боплан, - дуже вправні в добуванні селітри, якою рясніє Україна, і в приготуванні гарматного пороху». Виробництво пороху повністю забезпечувало потреби козацького війська.
«Поєднуючи з розумом, хитрим і гострим, щедрість і безкорисливість, козаки пристрасно люблять свободу; смерть воліють рабству, і для защищения незалежності часто повстають проти гнобителів своїх - поляків. Статури міцного, легко переносять холод і голод, спеку і спрагу; у війні невтомні, відважні, хоробрі, або, краще сказати, зухвалі, і мало дорожать своєю життям. Влучно стріляють з пищалей, звичайного своєї зброї. Козаки найбільш показують хоробрість і спритність в таборі, обгороджені возами, або при обороні фортець ».
Отже, найбільш стійкими козаки виявлялися в оборонному бою. Боплан зазначив вищі бойові якості козацької піхоти в порівнянні з їх кіннотою.
Основною зброєю козака була пищаль, крім того, він мав шаблю, часто пістолет і довгу піку. Застосовувалися також лук і стріли. Дальність польоту стріли в два рази перевищувала дистанцію стрільби з пищали.
Все запорізьке військо ділилося на полки. На початку XVII ст. офіційно значилося чотири полки по 500 козаків в кожному. Насправді полків було більше і чисельність їх була не однакова. Деякі полки мали по кілька тисяч чоловік. Полки ділилися на сотні, а сотні - на курені. Куренем командував отаман, сотнею - сотник, а полком - полковник. На чолі «вільного війська Запорізького» стояв кошовий отаман, який обирався радою (зборами) всього війська. Доручення кошового отамана виконували осавули, артилерією відав гармаш, канцелярією завідував писар.
Себе козаки називали «товаришами», а все своє військо - «товариством». Козаки дуже дорожили правом самоврядування і широко їм користувалися. Цей широкий козацький демократизм не суперечив високої військової дисципліни, якою характеризувався козацьке військо. Поза раді кошовий отаман користувався всією повнотою влади, мав право виносити вирок про застосування або скасування смертної кари. Все військо повинно було беззаперечно виконувати накази кошового отамана.
Козацьке військо мало невеликої за чисельністю, але гарною артилерією. У затишних місцях зберігалися військова скарбниця, бойові припаси, зброю і різні військові приналежності. Дбайливо зберігалися бойові прапори. У документах згадується військова музика - військові сурмачі, Сурмач і Довбишів, що били в котли, барабани і литаври.
На поході в степу козаки застосовували похідний табір, який представляв собою два ряди возів, замикає
8-10 возами. Піхота йшла всередині табору, а кіннота поза ним. На дистанцію до 500 м в усі боки висилалися одиночні вершники для спостереження. Як тільки показувався противник, табір зупинявся і готувався до відбиття нападу. На атаку табору татари вирішувалися лише тоді, коли їм вдавалося захопити козаків зненацька. У всіх інших випадках вони «тільки здалеку погрожували нападом, що не під'їжджаючи, однак, на рушничний постріл, і, пустивши через наші голови хмару стріл, - ховалися. Стріли їх летять дугою, вдвічі далі рушничного кулі ».
Для ведення оборонного бою запорожці мали табір в формі трикутника замість загальноприйнятого в той час каре (чотирикутника). Вози міцно зв'язувалися між собою залізними ланцюгами. На деяких возах встановлювалися легкі гармати. Усередині табору розміщувалися кращі стрільці з пищалей, що зустрічали атакуючого противника влучним вогнем. Безперервність ведення вогню забезпечувалася особливою організацією заряджання пищали. Кілька козаків заряджали пищали і подавали їх стрілку в готовому для пострілу вигляді. Виходила свого роду стрілецька група, від чисельності якої і від навичок обслуговував персоналу залежала скорострільність.
Розбудувавши ряди врата влучним вогнем пищалей, а іноді і гармат, козацька кіннота вихором вилітала з табору і клинками добивала здеморалізованого ворога. Перемога завершувалася енергійним переслідуванням.
На ворога козаки намагалися нападати раптово. Ніч вони використовували на зближення, а на світанку починали атаку, прагнучи оточити противника. Для ведення бою характерні висока маневреність, широка ініціатива і взаємна виручка.
Козацька кіннота в атаку зазвичай ходила «лавою», що представляла собою одну невирівняні шеренгу з загинаються крилами для охоплення флангів бойового порядку противника. Для зустрічі кінної атаки ворога козаки «батовалісь», т. Е. Будувалися в три шеренги.
Загони козаків здійснювали морські походи для нападів на селища Анатолійського берега Туреччини. З цією метою створювалася флотилія з 80-100 чайок, на яких розміщувалося 5-6 тис. Козаків.
Чайка будувалася довжиною до 18 м, шириною 3-4 м, глибиною до 4 м. По бортах прив'язувалися валики, сплетені з пучків очерету, які підвищували стійкість чайки, що не тонула і тоді, коли вона наповнювалася водою. Чайка мала два керма (на кормі і на носі), щоглу для вітрила і по 10-15 весел на кожному борту. На ній встановлювали дві гармати. На дні човна в бочках знаходився провіант - сухарі, пшоно, борошно. Кожна чайка вміщала від 50 до 70 осіб. 60 козаків на два тижні виготовляли один човен. За 2-3 тижні 5-6 тис. Козаків могли виготовити від 80 до 100 чайок.
Кожен козак, що вирушав у морський похід, мав шаблю, дві пищали, близько 3 кг пороху, запас куль і квадрант. Для легких гармат в кожній чайці було достатня кількість пороху і ядер.
На своїх чайках козаки за 36-40 годин перетинали Чорне море і з'являлися біля берегів Анатолії, наводячи страх на турків.
Чайка піднімалася над водою всього на 0,7 м, внаслідок чого козаки помічали турецькі кораблі раніше, ніж противник виявляв їх. Вони заходили із заходу, чекали ночі, а потім раптово атакували ворога, намагаючись кинутися на абордаж. Кращі стрілки в бою стріляли, а інші заряджали рушниці.
Про морські походи козаків один турецький історик писав: «Можна сміливо сказати, що в усьому світі не знайдеться людей сміливіших, які менш піклувалися б про життя, менше боялися б смерті; досвідчені в морській справі люди розповідають, що ця голота своєю спритністю і відвагою в морських битвах страшніше всякого ворога ».
Способи боротьби вутлих козацьких чайок з великими морськими кораблями заслуговують на особливу увагу.
Не менш цікаві способи виходу козацької флотилії в море і її повернення на Січ. Гирлі Дніпра зазвичай перегороджували турецькі галери, що мали значну осадку. Козаки пливли до гирла річки, де в 5-7 км від турецького флоту ховалися в очеретах, недоступних для галер противника. Потім, вибравши найтемнішу ніч (перед молодиком), дотримуючи абсолютну тишу, прослизали мимо турецьких галер і виходили в море. Цим же самим шляхом козаки поверталися рідко. Зазвичай вони причалювали в 5-7 км на схід від Очакова, звідки в долині волоком перетягували свої чайки в Дніпро. Іноді пливли в Азовське море, піднімалися вгору по р. Міус, далі волоком до р. Тавчавода, по ній в р. Самару і в Дніпро.