Після повалення тиранії і відновлення в Афінах демократії Сократ був звинувачений у безбожництві. Звинувачення виходило від трагічного поета Мелета, багатого шкіряника Аніта і оратора Ликона. У діалозі «Менон» Платон повідомляє, що Аніта, демократ, виганяли з Афін тридцятьма тиранами і учасник їх повалення, виявляє крайню ворожість перед софістами, кажучи, що «софісти - це очевидна загибель і псування для тих, хто з ними водиться». Коли Сократ, привівши в приклад пересічних дітей видатних афінян, висловлює впевненість, що «чесноти навчити не можна» Аніта грубо його обриває, після чого Сократ з гіркотою зауважує, що Аніта думає, що і він, Сократ, подібно софістам губить людей, В діалозі « Евтіфрон »Сократ каже випадково зустрінутому їм Евтіфрону, що якийсь Меле, людина, мабуть, молодий і незначний, написав на нього, Сократа, донос, де звинувачує його в тому, що він розбещує юнацтво, вигадуючи нових богів і ниспровергая старих. Евтіфрон заспокоює Сократа.
Однак навесні 399 р. До н.е. е. філософ постав перед судом присяжних. Як обвинувач виступив Меле, який заявив, що клятвено звинувачує Сократа в тому, що «він не шанує богів, яких шанує місто, а вводить нові божества, і винен у тому, що розбещує юнацтво; і покарання за те - смерть ».
Для успіху свого звинувачення Меле повинен був набрати принаймні п'яту частину голосів тих, хто засідав в геліея. У відповідь на звинувачення Сократ виголосив свою захисну промову, в якій спростовував висунуті проти нього звинувачення, після чого був визнаний винним вже більшістю голосів. Тепер Сократу треба було самому собі призначити покарання. Він запропонував присудити йому довічний безкоштовний обід в Пританее разом з олімпійськими чемпіонами, а в крайньому випадку - штраф в одну міну, після чого присяжні засудили Сократа на страту ще більшою кількістю голосів. Тоді Сократ виголосив свою третю мова, сказавши, що він уже старий (йому було тоді 70 років) і не боїться смерті, яка є або перехід в небуття, або життя в Аїді, де він зустрінеться з Гомером та іншими видатними людьми. У пам'яті ж потомства він, Сократ, назавжди залишиться мудрецем, тоді як його обвинувачі постраждають (і справді вони, згідно Плутарху, повісилися). Всі три мови Сократа містяться в платонівському творі «Апологія Сократа».
Сократа мали стратити відразу, але напередодні суду з Афін пішов на острів Делос корабель з щорічною релігійної місією. До повернення корабля страти заборонялися звичаєм. В очікуванні страти Сократові довелося тридцять днів провести у в'язниці.
Напередодні страти, рано вранці до Сократа, підкупивши тюремника, пробирається його друг Критон, який повідомив, що правоохоронці підкуплені і Сократ може бігти. Сократ відмовився, вважаючи, що треба коритися встановленим законам, інакше він уже емігрував би з Афін. І хоча тепер його засудили несправедливо, закон треба шанувати. Про це ми дізнаємося з платонівського діалогу «Критон». У діалозі ж «Федон» Платон оповідає про останній день життя Сократа. Цей день Сократ провів зі своїми учнями. Він каже їм, що не боїться смерті, тому що був до неї підготовлений усією своєю філософією і способом життя. Адже саме філософування, на його переконання, є не що інше, як вмирання для земного життя і підготовка до звільнення безсмертної душі від її смертної тілесної оболонки.
Увечері прийшла дружина Сократа Ксантиппа, прийшли родичі, привели його трьох синів. Він з ними попрощався і відпустив їх. Потім у присутності своїх учнів Сократ випив чашу рослинного отрути. Згідно з Платоном, Сократ помер тихо. Його останніми словами було прохання принести півня в жертву Асклепію. Таку жертву зазвичай приносили богу медицини видужали. Сократ же хотів цим підкреслити, що смерть тіла - це одужання душі. Неважко помітити, що «федоновскій» Сократ по-іншому уявляє собі смерть, ніж Сократ з «Апології». Це не дивно. Сократ з «Апології» ближче до історичного Сократа. У «Федон» ж Платон приписав Сократу вже свої, більш ідеалістичні погляди, вклавши в його уста свої чотири докази безсмертя душі. Така зовнішня сторона життя і смерті Сократа.