У порівнянні з іншими плодовими деревами гібридна алича менше страждає від хвороб і шкідників, проте іноді сортових достоїнств може не вистачити, щоб уберегтися від інфекції, перелітає від дільниці до дільниці.
В період збору врожаю особливо помітні плоди, уражені сірою гниллю кісточкових (моніліозом). Їх поверхня покрита дрібними сіруватими подушечками, в яких знаходяться спори гриба. При скупченому розміщенні на гілці здорові плоди заражаються від хворих. Тому їх треба негайно видаляти з дерева. А так як інфекція зимує в засохлих плодах, опалому листі, залишати їх на зиму в саду вкрай небажано. Під час листопаду постраждале дерево слід обприскати бордоською рідиною (300 г на відро води), а навесні, до цвітіння і відразу після, обробити препаратом скор (1 ампула на відро води).
Дірчастий плямистість листя (клястероспоріоз) теж грибне захворювання. Ранньою весною на листках з'являються дрібні червонуваті плями з розпливчастою облямівкою, через тиждень-другий на їх місці утворюються дірочки. При сильному зараженні листя засихають і опадають, нирки чорніють квітки обсипаються, плоди всихають до кісточки. На молодих пагонах з'являються червонувато-фіолетові плями а потім неглибокі виразки. Поступово дерево слабшає, урожайність падає Зимують спори на листках, корі уражених пагонів.
Поширення інфекції починається навесні, як тільки потеплішає до 4-6 градусів. Тому пошкоджену в минулому році аличу до розпускання бруньок слід обробити залізним купоросом (300 г на відро води), а після цвітіння - бордоською рідиною (100 г на відро води). І, звичайно, не можна загущать крону, негайно слід вирізати пошкоджені пагони, восени прибирати і спалювати листя.
Якщо раптово велика частина крони починає сріблиться, набуваючи сірий колір з металевим відливом, це означає, що алича захворіла, і хвороба називається помилковий молочний блиск. У такого дерева листя передчасно опадають, при цьому деревина гілок залишається зеленою і живий. Причина явища - підмерзання деревини після суворої зими і пов'язане з ним водне і мінеральне голодування. При гарному догляді (рясні поливи, підгодівлі) через рік-два дерево відновлюється.
Починати лікування слід з вирізки уражених гілок. При цьому зрізи обробляють мідним купоросом (10 г на 1 л води) і замазують олійною фарбою на натуральній оліфі. Якщо хвороба помічена вчасно і вогнище невеликий, прогноз сприятливий.
Надалі потрібно своєчасно вирізати сухі гілки, викорчовувати засохлі дерева, до розпускання листя проводити профілактичні обприскування медьсодержащими препаратами, ретельно дезінфікувати і обробляти всі спиляти і морозобоїни садовим варом, олійною фарбою. Корисно білити дерева, причому не тільки штамб, а й скелетні гілки, щоб захистити дерево від весняних сонячних опіків.
З шкідників, трапляється, аличі докучає попелиця. Вона пошкоджує молоді пагони навесні - на початку літа. Проти неї битву розумніше вести не хімічними препаратами, а рослинними настоями і відварами, які їй не до смаку. Для цього можна використовувати аптечну ромашку, чистотіл, часник, пасинки томатів, лушпиння цибулі.
Від останньої обробки рослин хімічними засобами до збору плодів повинно пройти 20-30 днів.