Пігменти - барвники, що додають колір рослинам.
Меланін - пігмент, що зустрічається як в клітинах рослин, так і тварин. Зокрема, він надає чорний і коричневий колір волосся. Відсутність меланіну в клітинах робить тварин і людини альбіноса.
Структура молекул меланіну жидкокристаллическая. Пігмент є сильним антиоксидантом. Синтетично продукувати меланін у водних розчинах надає на рослину дивовижні властивості - прискорює ріст і дозрівання плодів, редукує діяльність камбію, прискорює проростання насіння. В організмі тварин меланін володіє іммуномодулірованіем і генопротекторной захистом. У рослинах міститься в шкірці червоних сортів винограду, пелюстках деяких квіток.
Фітохром - блакитний рослинний пігмент білкового будови, контролює процеси цвітіння і проростання насіння. У одних рослин прискорюючи цвітіння, у інших - затримуючи. Фітохром грає роль "біологічного годинника" рослини, механізм дії поки не вивчений. Відомо, що будова пігменту міняється залежно від світлого і темного часу доби, сигналізуючи про це рослині. Phyton - від грецького рослина, сhrom - колір, фарба. Виявив меланін американський учений - біохімік У. Батлер в пророслому в темряві турнепсі, в його сім'ядолях. Ця речовина регулює синтез білкових молекул (ДНК, РНК), утворення хлорофілу, каротиноїдів, антоціанів, органічних фосфатів, вітамінів. Якщо хлорофіл можна порівняти зі схожими за будовою клітинами крові - еритроцитами, то фітохром підлягає образним порівнянням з мозком і пам'яттю рослини. Фітохром пов'язаний з клітинними мембранами і зустрічається практично у всіх органах рослини.
Антоціани - надають рослинам забарвлення в діапазоні від рожевого, червоного, бузкового, до синьої і темно-фіолетового. Антоціани утворюються в процесах гідролізу крохмалю і за своїм походженням є безазотними сполуками, близьким до глюкозиди - з'єднанням цукру з невуглеводної частиною. Посилене утворення антоціанів в клітинах рослини відбувається при зниженнях температур навколишнього середовища, при зупинках синтезу хлорофілу, при інтенсивному освітленні УФ-променями, при нестачі фосфору, необхідного для встрявання гідролізовані крохмалем цукрів. При цьому забарвлення листя рослин змінюється від зелених до червоних і синіх кольорів. Антоціани добре розчинні у воді і присутні в соку вакуолей. Діапазон кольорів змінюється завдяки наявності в рослині всього трьох моделей антоціанів, різних між собою числом гідроксильних груп. Варіації в пропорціях цих пігментів в рослинах дають різне забарвлення пелюсток. Залежно від кислотності (рН) середовища соку вакуолей, антоціан надає ту чи іншу окраcку. У кислому середовищі він зазвичай має червоні тони, наприклад, у герані, гортензії, фіалок. У лужної ці рослини набувають синьо-блакитні тони. Якщо ж до синього або фіолетового розчину антоциана додати кислоту, розчин знову стане рожевим. Дослідним шляхом це легко перевірити на рослинах, підбираючи в якості підгодівлі ті чи інші мікроелементи, що змінюють кислотність рідини вакуолей. Якщо до нейтрального розчину антоциана додати дуже слабкий лужний розчин - виходить блакитний колір, при більш концентрованому розчині лугу фарбування перейде в жовто-зелене. Червоне забарвлення - у маків, троянд, герані, синя - у волошок, блакитна - у дзвіночків обумовлена наявністю пігменту антоциана. Плоди винограду, слив, терну, червонокачанної капусти, буряка пофарбовані антоцианом. Вважається, що антоціан захищає рослини від низьких температур, від шкідливого впливу сонячного кольору на цитоплазму.
Антохлор - пігмент жовтого кольору. Зустрічається в клітинах шкірки пелюсток первоцвіту (баранчики, примула), льнянкі, жовтого маку, жоржини, в плодах лимонів та інших рослинах.
Антофеін - рідко зустрічається пігмент темного кольору. Викликає забарвлення плям на крилах віночка в українських бобів (Faba vulgaris).
Каротиноїди - містяться в рослинах, стійких до знижених температур. Коли хлорофіл вичерпується в холодну пору року, листя набувають помітну жовту або помаранчеве забарвлення за рахунок пролонгованої дії пігменту каротиноида. Каротиноїди захищають рослини від шкідливої дії сонячного світла, приймаючи УФ-випромінювання сонця на себе, трансформуючи в енергію і передаючи її хлорофілу. За допомогою такої передачі хлорофіл регулює процеси фотосинтезу. На доказ того, що каротиноїди присутні в листі постійно нарівні з хлорофілом, послужить наступний експеримент: до спиртової витяжки хлорофілу долити бензину 1: 1, збовтати суміш і дати відстоятися, суміш розсиплеться. Нижній шар зі спирту має жовте забарвлення і містить жовтий пігмент ксантофилл. Верхній бензиновий шар зеленого кольору і містить хлорофіл і каротин. Оранжево-червоний колір рослинам дає пігмент каротин, жовту - ксантофилл. Ці пігменти мають білково-ліпоїдному основу. Ці пігменти виявлені в плодах помідорів, апельсинів, мандаринів, в корені моркви. Основна роль цих пігментов- надати рослинам яскраву привабливу забарвлення, залучаючи птахів і тварин для рознесення насіння. Квіти з оранжево-жовтим забарвленням - жовтець, настурція.