Офіційна легенда - обкатка технології режиму скритності, але вся команда чує підступ, адже на борту незрозуміло для чого присутній суперагент- «спектр» туріанской зовнішності.
Шепард - командир десантного підрозділу, і з перших же слів він дає зрозуміти пілоту, чи можна із зірковим десантом жарти жартувати. Капітан викликає Шепарда в кімнату зв'язку - шляхом можна поговорити з навігатором, доктором і десантником Річардом Л. Дженкінсом. який жадає битв і слави.
У залі зв'язку нас зустрічає туріанін, а з тилу підкрадається капітан Девід Андерсон. щоб приголомшити новиною: мовляв, сюрприз! Тестовий політ лише прикриття для секретного завдання! Археологи розкопали маяк часів протеан (обов'язково розпитайте про них докладніше), і «Нормандія» в обстановці секретності повинна забрати цей артефакт, який може зберігати в собі таємниці технологій тих епох і розгадку таємничого зникнення стародавньої раси. А при чому тут «спектри»? Виявляється, Шепарда ось-ось висунуть в якості першого людини- «спектра», і агент посланий Цитаделлю, щоб оцінити кандидата.
Але дружня бесіда перерветься в найцікавіший момент: з Іден Прайм надійшов сигнал лиха. На планету напали невідомі вороги, гарнізон гнеться і мнеться, а єдиний військовий корабель поблизу - «Нормандія». У режимі скритності трьох десантників - Шепарда, Дженкінса і Кайда Аленко - скидають в зону розкопок, строго-настрого покаравши добути маяк. Туріанін теж висаджується на планету і тікає в блакитну далечінь.
Перша планета - саме час освоїтися з керуванням, поганяти напарників туди-сюди, постріляти в білий світ. Плаваючі «газові мішки» нешкідливі, їх можна використовувати як мішені. Неподалік валяється контейнер з корисним або не дуже предметом - в залежності від вашого везіння і вбудованого в гру генератора випадкових чисел.
За поворотом доведеться розлучитися з Л. Дженкінсом - він вискочить на відкритий простір і буде зведений нанівець літаючими роботами. Велика плоска скеля надасть Шепард і Кайдани зручне укриття для стрільби. Після бою огляньте тіло. «Треба не забути попросити місцевих поховати його», - скаже добрий Шепард. Злий відзначить: «Залишимо його тут, у нас завдання». Сенс один і той же, але різниця - приголомшлива!
У зоні розкопок повно гетхов, але маяка немає - його вже хтось забрав. Перевіримо, що стало з археологами. Шепард чує засідку, і його сумніви підтверджують кілька зомбі, які знімаються з штирів і біжать до наших героїв з розпростертими обіймами. Саме час потренуватися в джедайського трюках або в стрільбі з дробовика.
В одній з времянок ховаються перелякані археологи. Одного з них прорвало на похмурі пророцтва - мовляв, прийшли похмурі часи, людству кінець. Шепард може перервати потік нескладних слів. Удар в щелепу - це не дуже по-доброму, зате ефективно.
А наш знайомий туріанін тим часом потрапив в неприємності, наткнувшись на колишнього колегу, а нині лиходія на ім'я Сарен Артеріус.
Щоб дістатися до платформи, доведеться впоратися з дроїдом і декількома зомбі. Один влучний постріл в балон під тиском позбавить нас від частини проблем.
У халупі за пагорбом ховаються контрабандисти, які називають себе «селянами». Вони запропонують Шепард безкоштовний пістолет, але при бажанні з них можна вичавити ще трохи контрабандного товару і до того ж ім'я спільника. Той ховається за ящиками - він розповість, що сталося з туріаніном, і, якщо герой буде переконливий, підкине йому корисних речей. Тепер ми знаємо, де маяк - його встигли перевезти в поселення.
Дроїди підкралися непомітно. Обнишпорив платформу, не поспішайте спускатися по сходах до поїзда - вас там чекають. Краще зійти по сходах до наваленим камінню, причаїтися за парапетом і акуратно продірявити дроида-руйнівника видали.
Підібратися до поїзда буде непросто - його прикривають роботи. Вони стріляють здалеку, але вдалий результат бою - питання часу, якщо Шепард забереться в укриття і дістане снайперську гвинтівку.
Сарен наказав дроїд замести сліди, встановивши на станції чотири вибухові пристрої, а сам відправився до маяка, щоб зобразити польоти Девіда Копперфільда. І не залишилося б від колонії ні ріжків, ні ніжок, якби на поїзді не приїхала команда Шепарда.
У вашому розпорядженні п'ять хвилин, щоб знешкодити чотири бомби. З першої можна впоратися відразу ж, але з іншими доведеться повозитися. Гетхі водяться тут у великій кількості, але контейнер за сходами надасть вам перший укриття. Відстрілявши кілька роботів, Шепард по містку добереться до другої бомби і іншого укриття. Тепер можна особливо не поспішати. Ховаючись за ящиками, позбудьтеся від останніх дроїд, і знешкодьте дві останніх бомби. Від маяка вас відділяє ще пара роботів і зомбі - але не чіпайте археологічну рідкість, поки не обчистили всю платформу і не помилуєтеся видовищем розплавленої породи на тому місці, де приземлявся «Повелитель».
Звичайно, не обійшлося без сюрпризу - один з ваших напарників (хто саме - залежить від статі героя) ненавмисно активує маяк, і Шепард отримує прямо в мозок кілька сумбурним і незрозумілої інформації, перш ніж пристрій самознищується.
Поговоріть з лікарем про своє самопочуття, напихати при бажанні невдалому напарнику. Капітан Андерсон опише загальну ситуацію. Положення делікатне. Рада Цитаделі вимагає звітів, а операцію не можна назвати успішною. «Спектр» убитий, маяк знищений, самого Шепарда мучать мігрені і незрозумілі бачення.
Треба летіти в столицю галактики, на зоряну станцію під назвою Цитадель. щоб розповісти про свої пригоди і про те, яким поганим туріаніном виявився Сарен. Побродите по кораблю і віддайте команду пілоту Джокеру стикуватися із станцією.
Основна сюжетна лінія