У Буджак гагаузи масово переселилися зі своєю історичною батьківщиною, Добруджі, що на Балканах, в другій половині XVII - початку XIX століття, рятуючись від османського іга.Тогда ж частина переселенців дійшла до Запорізької області нинішньої України. Тут вони заснували свої села, де гагаузи проживають і понині, в значній мірі асимілювавшись місцевим населенням.
У другій половині XIX століття, рятуючись від примусової болгаризацію, що проводиться урядом звільненій від турків Болгарії, залишалися в Добруджі гагаузи змушені були переселитися до Греції, де вони обгрунтовуються в Східній Фракії і на північному Еврос. Тут гагаузькі поселення існують і понині.
Під час столипінської аграрної реформи частина гагаузів з Буджака переселяється в Казахстан, де їх нащадки живуть і зараз.
У 20-ті роки минулого століття багато гагаузи з Буджака, що знаходиться в той час в складі Румунії, в пошуках роботи переселяються до Канади, Бразилії та Аргентини.
У період колективізації велика група гагаузів переселилася і осіла в Узбекистані.
В даний час гагаузи проживають також в Росії, Туркменії, Латвії, Естонії, Грузії, Болгарії, Румунії, Туреччини.
Відповісти на питання, хто такі гагаузи, і дати розумне пояснення їх походженню намагалися багато вчених. Але, тим не менш, в ранній етнічної історії гагаузів донині багато білих плям, і питання про походження цього народу спірне. Найвідоміший з сучасних дослідників гагаузької етнографії, Михайло Губогло, сам гагауз за походженням, вказав на існування двадцять одній версії про походження гагаузов.Еті версії вельми різняться між собою.
У Туреччині, наприклад, популярна версія про те, що гагаузи є нащадками малоазійських турків, що переселилися в XIII столітті під керівництвом султана Кейкавуса в Добруджу. Тут Кейкавус заснував першу державу гагаузів Узіеялет.
Російські, молдавські і гагаузькі вчені вважають, що гагаузи - самостійний народ, який сформувався на основі северотюркскіх племен печенігів, узов і половців, що переселилися на Балкани з Середньої Азії в Х столітті, після розгрому Казарського царства російським князем Святославом, і взяли тут християнство.
Відповідно до теорії історика Д.Тодорогло, гагаузи за походженням, гагаузи походять від знову ж тюркського племені Огуз, які під час прийняття тюрками ісламу зберегли вірність старої язичницької віри і покинули Центральну Азію, оселившись на північ від Каспійського та Чорного морів між Волгою і Дунаєм, заснувавши згодом в Добруджі перша держава гагаузів Узіялет, і перейнявши потім від візантійців християнство.
Однак, останні наукові дослідження в області етнічної геноміки спростовують всі численні версії істориків про походження гагаузів від тюркських племен, будь то сельджуки, печеніги, половці або огузи, що переселилися на Балкани з Азії. У порівняльному дослідженні генів тюркомовних народів колишнього СРСР, яке охопило не тільки Волго-Уральський регіон, а й Північний Кавказ, Середню Азію і Сибір було обстежено понад 8 000 осіб з 60 популяцій. При цьому було виявлено повну відсутність у гагаузів «азіатських» ліній мітохондріальної ДНК. Тобто гагаузи за своїм походженням - європейці. Тому, з урахуванням викладеного, більш правильною видається версія про походження гагаузів від фракійського племені каттаузов, висунута деякими грецькими дослідниками.
Основними заняттям каттаузов були скотарство і землеробство. Завдяки цьому вони змогли пережити часті набіги кочових племен і проходили через їх територію переселення народів. Чи не вплинуло на їх присутність на цій території також і падіння спочатку Римської, потім Візантійської імперії. Каттаузи вистояли і адаптувалися до нових політичних і економічних умов.
Утвердження християнства як офіційної релігії призвело до християнізації всіх народів на Балканах, в тому числі і каттаузов. З огляду на, що каттаузи прагнули жити ближче до міст, щоб швидше і вигідніше продавати свою продукцію, вони були еллінізувати, а елінізовані населення легше прийняло християнство в зв'язку з поширенням нової релігії через грецьку мову.
Після закінчення хрестових походів на території нинішньої Болгарії було утворено три князівства. У Тирновського і Відінська царство населення було в основному болгарським. Більшість населення Добруджанского князівства становили каттаузи. Крім них, на цій території проживали візантійські греки, влахи, кумани і турки-сельджуки.
Особливого розквіту князівство досягло в роки правління Добротіци, який відокремлюється від двох інших болгарських князівств і зближується з Візантією. Флот Добротіци домінував на Чорному морі і становив жорстку конкуренцію в торгівлі Генуї.
Після завоювання Константинополя османами і проголошення Патріарха Константинопольського в якості релігійного і політичного лідера всіх християн, каттаузи стають частиною християнського Міллет. Згодом слово "каттауз" трансформувалося в "гагауз". А так як гагаузи проживали серед османських турків, щоб вижити і бути в змозі обмінюватися товарами, поступово забули свою мову і стали говорити по-турецьки.
Характерно, що гагаузька мова схожа на мову балканських османів, а не на мову османів Малої Азії.
У висновку можна з упевненістю сказати, що гагаузи є фракийским племенем північній Болгарії, яке має тільки одну специфічну рису по відношенню до інших фракийцам. Вони тюркомовні, але є переконаними християнами.