Госпрозрахункова аптека може входити в систему фармацевтичного управління Міністерства шляхів сполучення або в систему різних управлінь міністерства охорони здоров'я.
Організація і виробнича діяльність госпрозрахункової аптеки регламентуються спеціальним положенням, затвердженим Міністерством охорони здоров'я. Відкривається аптека на підставі наказу обласного аптечного управління або міністерства охорони здоров'я, а також відповідного відомчого управління, якщо аптека підпорядкована цьому відомству.
Основне завдання будь-якої госпрозрахункової аптеки - забезпечувати населення, заклади охорони здоров'я та інші установи, підприємства та організації лікарськими засобами, предметами санітарії, гігієни та догляду за хворим, перев'язувальними матеріалами та іншими предметами аптечного асортименту.
Відповідно до цим завданням аптека повинна проводити такі види роботи:
1) виготовляти, контролювати і відпускати ліки населенню по оформленим відповідно до встановлених правил рецептами;
2) продавати населенню лікарські засоби, дозволені до відпуску без рецептів, а також перев'язувальні матеріали, предмети санітарії, гігієни та догляду за хворими, мінеральні води та інші медичні вироби;
3) забезпечувати медикаментами та іншими медичними виробами лікувально-профілактичні установи, дитячі сади, санаторії і т. Д .;
4) проводити санітарну роботу серед населення;
5) активно вести інформаційну роботу серед лікарів та інших медичних працівників про нові лікарські засоби і способи їх застосування, про замінниках відсутніх препаратів, про можливу стандартизації часто повторюваних рецептурних прописів і т. Д .;
6) організовувати заготівлю лікарської рослинної сировини в номенклатурі і обсязі, затверджених вищестоящою організацією;
7) надавати в необхідних випадках долікарську медичну допомогу.
На аптеку, що складається на самостійному балансі і що є юридичною особою, поширюється «Положення про державне виробниче підприємство». Аптека має штамп і круглу печатку з позначенням свого найменування.
Госпрозрахункова аптека може бути базою для науково-дослідних робіт, виробничої практики студентів середніх та вищих фармацевтичних закладів і слухачів факультетів удосконалення провізорів, а також школою передового досвіду.
Час роботи аптеки встановлюється управлінням за погодженням з відповідним органом охорони здоров'я. Кожна аптека повинна мати вивіску, вказівка про час роботи і відомості про знаходження чергових аптек.
У своїй виробничо-господарській роботі аптека повинна широко використовувати досягнення передового досвіду і наукову організацію праці.