Діти Геннадія Малахова і його дружина, за словами народного цілителя, перші люди, на яких він відчуває свої рецепти. І, якщо вони піддавалися йому, коли були поменше, то, ставши дорослими людьми, вже його порад не питають. Дочка Геннадія Малахова закінчила Державний педагогічний інститут в Ростові, отримавши спеціальність лінгвіста-перекладача. Катерина досконало володіє двома іноземними мовами - німецькою та англійською і зараз займається своєю кар'єрою. Старший Леонід - вже встиг обзавестися сім'єю і подарувати Геннадію Петровичу внучку Єву.
Діти Геннадія Малахова, хоча і мають власний погляд на здоровий спосіб життя, все-таки, іноді користуються рекомендаціями свого батька - адже він стільки встиг дізнатися про різні методи народної медицини. Геннадій Петрович написав кілька книг про те, як за допомогою народних методів лікування зберегти своє здоров'я, а на гонорари від них побудував великий триповерховий будинок в рідному Каменськ-Шахтинський, в якому живе зі своєю дружиною - Ніною Михайлівною, на якій одружився в 1981 році. Діти Геннадія Малахова зараз живуть в своїх квартирах, але цей будинок, за його словами, все одно дістанеться їм.
Народний цілитель розповідає, що його дружина, як справжня російська жінка повністю взяла всі турботи по облаштуванню будинку в свої руки, а він забезпечував її грошима. Малахов зізнається, що заробляти йому доводилося нелегкою працею - зйомки на телебаченні під час підготовки передач «Малахов +» тривали по дванадцять годин, але навіть в ті часи Геннадій Петрович не збирався переїздити до Москви назовсім - приїжджав тільки на записи, а потім знову повертався в рідний Каменськ-Шахтинський.
