Муніципальне право як галузь права, як наукова дисципліна має свою систему, основою якої є структура галузі права, яку вона вивчає.
Система наукової дисципліни муніципального права включає в себе наступні розділи:
1. Введення в муніципальне право, що розкриває поняття муніципального права як галузі права і наукової дисципліни, його предмет і джерела, історико-теоретичні основи місцевого самоврядування.
2. Поняття, основні принципи місцевого самоврядування, форми безпосередньої демократії, органи місцевого самоврядування.
3. Основи місцевого самоврядування, які включають правові, територіальні та фінансово-економічна основи.
4. Питання місцевого значення та повноваження органів місцевого самоврядування щодо їх вирішення, що включають: поняття і форми реалізації повноважень органів місцевого самоврядування, а також конкретні повноваження органів місцевого самоврядування в різних сферах життєдіяльності населення.
5. Гарантії місцевого самоврядування, які включають: систему гарантій; гарантії, що забезпечують організаційну і фінансово-економічну самостійність місцевого самоврядування; судову і інші правові форми захисту місцевого самоврядування.
6. Контроль діяльності органів і посадових осіб місцевого самоврядування.
7. Відповідальність органів та посадових осіб місцевого самоврядування. В цьому розділі вивчаються: види відповідальності органів і посадових осіб місцевого самоврядування; відповідальність перед населенням муніципального освіти, державою, фізичними та юридичними особами.