Як правило, в осіб, щодня палять марихуану, істотно знижується життєва ємність легенів (ЖЕЛ). Так як при курінні марихуани глибоко затягуються і намагаються довше утримати цей обсяг в легких, у наркоманів швидко розвивається хронічне подразнення бронхів. У осіб, одночасно кращих і тютюн, і марихуану - дифузійна здатність монооксиду вуглецю при одному вдиху (DLco) порушується різкіше, ніж у осіб, хронічно кращих тютюн. В даний час, правда, немає переконливих даних на користь того, що куріння марихуани збільшує ризик виникнення раку легенів, як це незаперечно доведено по відношенню до тютюнопаління. Але слід пам'ятати, що особи, які злісно використовують марихуану, ще недостатньо тривалий термін знаходяться під медичним контролем в США, щоб достовірно відповісти на дане питання.
Хоча куріння марихуани несприятливо впливає на багато систем організму, необхідні подальші контрольовані дослідження в цьому напрямку. Так, наприклад, повідомлення про кореляцію між використанням марихуани і зниженням рівня тестостерону в крові в подальшому не підтвердилося.
Повідомлялося також про те, що куріння марихуани призводить до зниження числа сперматозоїдів в одиниці об'єму, до зменшення їх рухливості і порушень їх морфології. Використання великих доз марихуани у самок макак резусів виявило значне пригнічення освіти гонадотропінів в гіпофізі і гонадального стероїдів. Ретельно проведені проспективні дослідження показали досить чітку кореляцію між зростанням і розвитком плоду і злісним вживанням марихуани під час вагітності. При вживанні марихуани відзначаються також порушення в імунній системі, в морфології хромосом, гальмується синтез ДНК, РНК і білків, але все це не можна віднести до специфічних впливів марихуани на організм людини. Повідомлялося про виникнення атрофії мозку, пов'язаної з вживанням індійської коноплі молодими людьми, але це не підтвердилося при дослідженнях з використанням КТ мозку.
Толерантність до марихуани і виникнення фізичної залежності від неї. У осіб, що вживають марихуану, досить швидко формується толерантність до її психоактивних ефектів, що змушує наркоманів вдаватися до більш частого паління і збільшення вмісту діючої речовини в сигаретах. Швидкість, з якою розвивається толерантність, різна. Так, наприклад, толерантність до тахікардії розвивається швидко, а до кон'юнктивальної гіперемії - повільніше. Слід зазначити, що після припинення вживання марихуани толерантність до поведінкових і фізіологічних ефектів цього наркотику дуже швидко зменшується. У осіб, хронічно вживали марихуану і припинили приймати цей наркотик, розвиваються різко виражені симптоми синдрому відміни. Ступінь вираженості зазначених симптомів залежить від доз, в яких приймався наркотик, і тривалості його вживання. Ці симптоми включають тремор, підвищену пітливість, нудоту, блювоту, пронос, дратівливість, відсутність апетиту, порушення сну. Симптоми марихуанового синдрому відміни зазвичай бувають виражені не так різко, як симптоми опиатного або алкогольного синдрому відміни; і таким хворим зазвичай не потрібно медичної допомоги або медикаментозного лікування. Більш виражені і абстинентні синдроми виникають при припиненні тривалого застосування інших хімічних інгредієнтів конопель, що володіють високою біологічною активністю.