Стероїди виводяться з організму головним чином нирками, не завдаючи шкоди при помірному їх вживанні. Існує ряд захворювань в терапії яких стероїди є основними компонентами. Наприклад, у хворих на анемію при порушенні ниркової діяльності для поліпшення кровотворної діяльності та підвищення чисельності еритроцитів серед формених елементів крові використовують анаболічні стероїди. При втраті маси тіла, при діагностуванні гипогонадизма не виключаючи хворих на гемодіалізі, також застосовують стероїди.
Існує низька ймовірність негативних ефектів при короткостроковому прийомі стероїдів. Рідко реєструвались свідчення про глобальні зміни у функціонуванні нирок у атлетів- «хіміків» у вигляді онкологічних деструктивних порушеннях тканинної структури та освіті пухлини Вільмса (аденосаркома нирки). Такий вид раку, як правило, реєструється у дітей, і потрапило до рідкісних злоякісних пухлин. Прямого впливу ААС на розвиток міелоніцітов в ниркової тканини не виявлено.
Схожі освіти були помічені знову ж, у «хіміків», але вже в епітеліальних шарі мозкової речовини тканини нирок у вигляді появи карциноми клітин або одночасному ураженні печінкової і ниркової тканини. Ниркова недостатність в даному випадку була викликана, швидше за все, стероїдами і стала причиною тубулярного некрозу з нирковою недостатністю.
При довгостроковому застосуванні АСС потрібно відстежувати стан нирок. особливо під стресовими навантаженнями, які виникають при тренуваннях з використанням великих ваг. Особливо важливо розуміти, що пошкоджені м'язові тканини продукують миоглобин, а також різні нефротоксичні речовини, що потрапляють в кров'яне русло. Такий стан називають рабдоміоліс. У разі сильної течії може утворюватися ниркова недостатність шляхом пошкодження ниркової тканини. У культуристів зафіксовані ускладнені випадки рабдоміоліса, причому це не залежало від вживання стероїдних препаратів. Відомі випадки провокування гіпертонічних кризів або просто гіпертонії при використанні ААС, що згодом веде до патології нирок.
Однак загальне помірне споживання андрогенно-анаболічних стероїдів не може бути розцінено як загрозу для здоров'я нирок.