Академія - це місце, де збираються потенційні шиноби, яких фактично не вважають ніндзя, поки ті не випустять зі школи. Учні академії витримують теоретичні та практичні тести всіх типів, де вивчаються основні навички ніндзя: військове мистецтво, джуцу, фізична витривалість і стиль життя шинобі. Зазвичай їм викладається використання основного зброї, такого як куна і сюрікени. Також викладаються різні елементарні техніки, мінливі від села до села. Кінцевий іспит академії змінюється від школи до школи, в Селенії Листя він складається з свого роду письмового тесту та демонстрації фундаментальних технік. Єдиним учнем, нездатним використовувати чакру, коли-небудь навчалися в Академії, був Рок Лі. Після отримання диплома випускники отримують начольну пов'язку ( «хіта-ате») з металевою пластинкою, на якій зображений символ їх селища. Деякі, втім, носять її нема на лобі, а, наприклад, на руці або поясі. Крім того, деякі селища застосовують додатковий випускний іспит, який влаштовує кожен сенсей-джонин своїй команді з трьох учнів, щоб перевірити, чи дійсно вони готові стати справжніми ніндзя і працювати в команді. Таким чином, гарантується, що тільки справді кваліфіковані ніндзя отримують звання Геніна. Ці іспити різняться в залежності від вчителя, який їх проводить.
Щоб досягти рівня Чунін, Генин разом зі своєю командою має взяти участь у великому іспиті ( "Іспиті на звання Чунін"), який проходить двічі на рік через зростаючого числа шиноби в селах. У минулому кожне село проводила свій власний іспит, але після Третьої Світової Війни Ніндзя союзницькі країни погодилися проводити його лише в одному обраному селищі, таким чином покращуючи і зміцнюючи свої відносини. Інша перевага полягає в тому, що ніндзя, який бере участь в цьому заході, приваблює клієнтів, які можуть зацікавитися його наймання. Іспит на звання Чунін - це випробування не тільки сили, але і здібностей збирати інформацію, виживати у важких умовах і дотримуватися керівні вказівки. Тих, хто має всі ці якості, розподіляють по парам для проведення турнірних поєдинків, за якими спостерігають судді, які приймають рішення кого просунути в званні, а хто цього не заслуговує. Переможець дуелі має право перейти до наступного бою, але головну роль при винесенні рішення журі грає не перемога, а дії шиноби під час поєдинків. Таким чином, будь-який, хто доходить до третьої стадії іспиту, навіть прийняв участь лише в одному поєдинку, має шанс стати Чунін, навіть якщо він фактично програв бій (наприклад, Нара Шикамару). При цьому перемога в фіналі не гарантує одержання ступеня Чунін.
Токубецу Джонін ( «особливий вищий ніндзя», іноді скорочується до Токуджі) - ними є ніндзя з рівнем і здібностями джонин, але яких готують лише в одній певній галузі військової науки. Це елітні фахівці, що знаходяться в групах під командуванням звичайного джонин або очолюють загони, яким довіряють завдання одного, характерного роду. Один із прикладів Токуджі - це Ібікі (експерт в допитах) і Ебісу (досвідчений вчитель)
Ті, хто отримали звання Каге ( «тінь»), стають главою одного з п'яти найсильніших Прихованих селен світу Наруто - це еліта селен, найдосвідченіші шиноби, чия сила колосальна, а мудрість не має кордонів. Незважаючи на це, з часом вони можуть частково втратити свою колишню міць і бути перевершені іншими, більш молодими ніндзя. Положення Каге знаходиться нарівні з правителем його країни, основними завданнями якого є нагляд за діяльністю своїх сіл і лідерство над суспільством-ніндзя. Каге може піти і залишити свій титул кому-небудь іншому, в іншому випадку ніндзя залишається на цій посаді до кінця своїх днів. Це створює ситуацію, коли в один і той же відрізок часу є два Каге, з яких фактично лише один виконує обов'язки правителя. Згодом з'явилася тенденція присуджувати титул людям, які мають родинні зв'язки або ті, хто був учнем / учителем попередніх Каге. В аніме введений шостий Каге з Країни Ведмедів, селища Прихованої Зірки - Хошікаге ( «Тінь зірки»). Однак, цим титулом шиноби наділив себе сам і визнають це лише його співвітчизники. Більшість Каге - це ніндзя рівня S.
Титули п'ятьох Каге змінюються в залежності від Селища, до якого вони належать:
• Хокаге (Тінь Вогню): глава Селища, Прихованого в Листі.
• Мізукаге (Тінь Води): глава Селища, Прихованого в Тумані.
• Цучікаге (Тінь Землі): глава Селища, Прихованого в Скелях.
• Райкаге (Тінь Блискавки): глава Селища, Прихованого в хмарах.
• Казекаге (Тінь Вітру): глава Селища, Прихованого в Піску.
Ніндзя рівня S набагато сильніше звичайного джонин. S-рівень не відноситься до звичайних звань, офіційно таких ніндзя називають джонин, вони можуть ставитися навіть до ще більш низьким звань або ж взагалі не мати ніякого. Відданість шиноби цього рангу полягає в тому, щоб бути частиною власного селища і проявляти до нього лояльність, навіть не живучи в ньому. Часто ніндзя цього рівня вирішують покинути своє селище, пускаючись на пошук своїх амбіцій, і стають ніндзя-зрадниками. Також ніндзя цього класу часто фігурують в книзі «Бінго», списку ворогів для вбивства, який має кожне село для використання джонин і членами команди АНБУ. Більшість шиноби, навіть вищого рівня, уникають прямого зіткнення з ніндзя рівня S. Ніндзя цього рівня значно вирізняються з-поміж інших і часто мають прізвиська, які їм дали їх друзі або вороги.
Команда особливого призначення АНБУ (дослівно «темна сторона», абревіатура від Ансацу Сенджуцу Токус Бутан, «Особлива команда з тактики вбивств») - спецназ, який перебуває під прямим контролем Каге. Члени AНБУ носять порцелянові маски, що мають форму тварин, для того, щоб виділятися серед інших шиноби і залишатися невпізнаними. Також вони мають стандартну уніформу, що складається з чорної і сірої броні, захисних пластинок для рук і татуювання у вигляді спіралі на лівому плечі, крім того, вони носять з собою ніндзя-то (меч ніндзя), який зазвичай прикріплюється до спини. Деякі з них на стандартні уніформи надягають чорні плащі з капюшонами, в той час як лідер команди може носити плащ білого кольору. Всі члени АНБУ прекрасно розбираються в анатомії людського тіла, на основі чого були вигаданою заявником різні потужні техніки, наприклад джуцу, паралізує противника. Одне з можливих її підрозділів - це Ніндзя переслідувачі (ойнін), основне завдання якого полягає насамперед у затриманні ніндзя-зрадників, а потім в повному знищенні їхніх тіл, таким чином уникаючи витоку в інші селища важливої інформації про тип чакри і різних анатомічних ознаках.
Схожі організації
Коноха має дві організації, схожі на АНБУ, але не є його підрозділами. Військова Поліція Листя (Коноха Кеймен Бутан), або просто Військова Поліція є унікальною організацією в Селенії Листя, хоча і інші села можуть мати подібні системи. Символ Військової Поліції - герб заснував її клану Учіха на тлі сюрікена. Колись вона в основному складалася з членів саме цього клану, однак зараз нікого з них вже немає в живих. Дана організація займається дотриманням законів в Селенії, і має практично необмежену юрисдикцію. Проте, вона не може втручатися в області, які знаходяться під прямим контролем Хокаге. Також вони поважають слідчу систему і внутрішню дисципліну організації АНБУ.
Нідз-сётай (Нідз: се: тай, Загін двадцяти) - це оперативна група, створена Цунаде, П'ятої Хокаге. Ця військова частина була створена для розшуку, захоплення і, в разі необхідності, усунення членів організації Акацукі на території Країни Вогню. Нідз-сётай складається з 20-ти команд, кожна з яких налічує чотирьох членів.
АНБУ Селища Листя зазвичай підпорядковується прямим командам Хокаге, але за кілька років до перших подій історії «Naruto», існував Департамент підготовки АНБУ відомий як Корінь (н.е.). Організація була заснована і безпосередньо очолена Danza, який посилено навчав і конденсував світогляд дітей. Корінь сприяє повного усунення емоцій, щоб дати можливість своїм членам доводити до кінця місії, не стримуючи себе. Ця організація має тенденцію слідувати і далі своїм переконанням: шинобі, на відміну від більшості інших груп ніндзя, не повинен показувати ніяких почуттів (з згадок Сая про правила після того, як у нього був знайдений подарунок його «брата»). Вважається, що Корінь використовував методи, подібні випускного іспиту Академії Селища Кривавого Туману, який включав в себе смертельні двобої між студентами-друзями. З того моменту як Дандзо почав вести військову політику, що суперечило ідеям Третього Хокаге, Корінь був розформований. Незважаючи на це, багато ніндзя залишилися віддані організації. Навіть якщо організація показує нам, що має хороші намірам, Цунаде і Джирайя ставляться до неї з підозрою.