Праймер - короткий фрагмент нуклеїнової кислоти або пов'язана молекула, служить вихідним пунктом реплікації ДНК. Праймер потрібен тому, що жодна ДНК-полімераза (фермент, який каталізує реплікацію ДНК) не може почати синтез нової молекули ДНК з одноцепочечной матриці, оскільки потрібна дволанцюжкова ділянку для приєднання до ДНК, а також вони здатні тільки приєднувати нуклеотид до вже наявної - ОН групи на 3 'кінці іншого нуклеотиду.
реплікація ДНК
У природному реплікації ДНК, як праймерів використовуються короткі ланцюжки РНК довжиною близько 12 нуклеотидів, синтезуються ферментомпраймазою. Праймазой може приєднувати як рібонулеотіди, так і дезоксирибонуклеотидов, але синтезує саме фрагмент РНК, оскільки рибонуклеотидов в ядрі більше. Ці молекули РНК пізніше вилучаються і замінюються на ДНК ДНК-полімерази.
штучні праймери
Багато лабораторних методів біохімії та молекулярної біології, залучають використання ДНК-полімерази, наприклад секвенування ДНК і полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР), вимагають праймерів. Праймери, що використовуються в цих методах, зазвичай короткі, хімічно синтезовані молекули ДНК довжиною 20-30 підстав.
Для клонування послідовностей ДНК часто в послідовності праймерів вводять додаткові нуклеотиди - сайти рестрикції, за якими ріжуть ферменти рестріктази. Після примноження потрібної ділянки ДНК в ПЛР, отримані молекули змішують з ферментом, який розрізає їх, утворюючи на кінцях так звані «липкі кінці». Такі кінці дозволяють легко вставити продукт ПЛР до штучного ДНК-вектора.