Ще одним важливим додатком обмеженою завдання трьох тіл є орбіти комет.
Крижані тіла комет, зазвичай діаметром кілька кілометрів, набагато менш масивні, ніж планети. Якщо комета пролітає повз планету, її тяжіння занадто мало, щоб вплинути на практично кругову орбіту планети. З іншого боку, орбіти самих комет зовсім навіть не кругові. У більшості випадків вони настільки витягнуті, що схожі на параболи. На відміну від планет, які рухаються поблизу середньої площині Сонячної системи, комети переміщуються по орбітах, довільно орієнтованим щодо цієї площини.
Здається, сучасні орбіти комети сильно відрізняються від вихідних. Рухаючись по типовою орбіті, комета віддаляється від Сонця в 1000 раз далі Плутона. Але коли вона входить в область планет, особливо - в потужне гравітаційне поле Юпітера, її орбіта відчуває сильні обурення. Якщо в результаті комета загальмується, вона на тривалий час може перейти на орбіту меншого розміру. Якщо ж обурення збільшать швидкість комети, вона може взагалі покинути Сонячну систему. Навіть якщо орбіта комети спочатку лежала в площині Сонячної системи, планетні обурення можуть вивести її з цієї площини на таку орбіту, які зазвичай спостерігаються в наш час.
Хороший приклад комети, захопленої планетами, демонструє нам комета Галлея. Історія її відкриття сходить до Ньютону, який показав, як можна обчислити орбіту комети, якщо вдалося виміряти її положення на небі протягом декількох ночей. Використовуючи цей метод, Едмунд Галлей зайнявся обчисленням орбіт тих комет, які були відкриті в попередні століття. Особливо уважно він поставився до комет 1531,1607 і 1682 років, орбіти яких виглядали практично однаковими. В1705 році він прийшов до висновку, що це одна і та ж комета, яка з проміжком в 76 років наближається до Сонця по витягнутій орбіті. Крім того, виявилося, що практично по тій же орбіті рухалися і комети 1305,1380 і тисячу чотиреста п'ятьдесят-шість років. Тому Галлей передбачив, що ця комета знову з'явиться в 1758 році.