Як видно зі схеми освіти пептидів, поліпептидний ланцюг має определ ?? енное напрямок, оскільки кожен з її будівельних блоків (амінокислотних ланок, або залишків амінокислот) має різні кінці - або N-аміно, або С-карбоксильная група. Амінокислотний залишок, що знаходиться на тому кінці молекули, де є вільна # 945; -аминогруппами, прийнято називати N-кінцевим залишком (N-кінець молекули), а залишок на протилежному кінці, що несе вільну карбоксильну групу, - С-кінцевим (С-кінець молекули). Наприклад, для трипептида:
N - кінець → (H2 N) ала - гли - три (OH) ← С-кінець
(Початок ланцюга) (кінець ланцюга)
Умовно прийнято вважати, що поліпептидний ланцюг починається з N-кінця, ᴛ.ᴇ. кінця, несе # 945; -аминогруппами. Для умовної записи пептидів використовують трьохбуквені скорочення скорочені позначення # 945; -амінокислот (див. С.5). При зображенні послідовності амінокислот в пептидного ланцюга починають з N-кінцевого залишку. Так, в трипептиди ала - гли - три аланин несе кінцеву аміногрупу, а триптофан - кінцеву карбоксильну групу. Зверніть увагу, що три - гли - ала - ϶ᴛᴏ вже інший трипептид!
Назви пептидів утворюють з тривіальних назв амінокислотних залишків відповідно до їх послідовністю, починаючи з N-кінцевого залишку. С-кінцевий залишок зберігає своє тривіальне назва. Назви амінокислотних залишків виробляють з назв відповідних амінокислот шляхом заміни їх закінчення на закінчення''іл'', характерного для назв одновалентних залишків (радикалів). Наприклад, гліцин (залишок - гліцил), валін (залишок - валив), фенілаланін (залишок - фенілаланіл), аспарагін (залишок - аспарагіл), аспарагінова кислота (залишок - аспарагін) і т.д.
Назва трипептида ала - гли - три буде наступним: аланіл - гліцил - триптофан.
У разі якщо амінокислотний залишок повторюється в ланцюзі більше одного разу підряд, то перед його назвою використовують відповідну приставку: 2 рази - ді, 3 - три, 4 - тетра і т.д. Наприклад, пентапептид ліз - (про) 2 - тир - ГЛН матиме назву: лізил - діпроліл - тирозил - глутамин.
При наявності в пептиді як С-кінцевого залишку глутамінової або аспарагінової кислоти, їх називають одним словом - глутамат і аспартат відповідно. Наприклад, назва тетрапептіда про - мулі - асп - асп буде наступним: пролив - ізолейцил - аспарагін - аспартат.
Читайте також
Оскільки амінокислоти в складі пептидів знаходяться в формі ацилов (кислотних залишків), то в назві пептидів їм надають характерне для ацилов закінчення «мул». Назва кінцевої амінокислоти з вільною карбоксильною групою залишають без змін (Рис. 1.17). [Читати далі].
Оскільки амінокислоти в складі пептидів знаходяться в формі ацилов (кислотних залишків), то в назві пептидів їм надають характерне для ацилов закінчення «мул». Назва кінцевої амінокислоти з вільною карбоксильною групою залишають без змін (Рис. 1.17). [Читати далі].