У дитинстві Мінато був талановитим шиноби і закінчив Академію ніндзя в досить ранньому віці - в 10 років. Ще в академії він врятував Кушин Узимку, викрадену шиноби Кумогакуре.
Пізніше він став учнем легендарного саннінаКонохі Джірайі.О його навчанні в команді було відомо зовсім мало, крім того, що Джирайя навчив його закликати жаб. Мінато добре розвивався як шинобі і створював такі сильні техніки какРасенган. На оволодіння цієї техніки у нього пішло цілих три роки. Техніка Летючого Бога Грому - його творіння. Його товаришами по команді були Акімічі Чоуза і Абураме Шиби.
Зустріч з Кушин
Кушина прийшла в академію після переїзду і відразу заявила, що стане першою жінкою-хокаге в історії села. На що Мінато відповів: "Я стану кращим хокаге в історії, яким буде захоплюватися все село!" Кушина сподобалася йому, але в її очах він виглядав слабким і не подавав надій. Мінато став прглядивать за дівчинкою, але намагався робити це таємно, так як навіть він боявся гнів Кушина. Пізніше пояснивши це словами: "Ти сильна. І душею, і тілом." Одного разу все змінилося. Так як у Кушин незвичайна чакра, село Хмари вирішила захопити її і забрати в село. Вони йшли через ліс. Дівчина залишала слід зі свого волосся, думаючи, що її хтось врятує. Пізніше, все списавши на ненормально. Вони підходили до кордону. Несподівано якась тінь стало перелітати з кутка в куток і вирубувати шиноби. А Кушина все йшла і йшла, поки нарешті не зупинилася і не підняла голову. Перед нею стояв Мінато і посміхався. Дівчина зраділа і мало не впала, але хлопець підхопив її, взяв на руки і вискочив з лісу. Кушина помітила клаптик свого волосся в руці Мінато, а він сказав: "Твої волосся прекрасні." Що вкрай збентежило Кушина. Вона запитала чому він її врятував, якщо вже вона ненормальна. "Ти живеш в Конохи, ти одна з нас." - звучала відповідь, після якого в он піднявся в її очах. Вона полюбила свої червоні волосся і Мінато.
Минуло багато років, і вони одружилися. Мінато виконав свою мрію стати хокаге. В один день, Кушина ходила до лікаря і дізналася, що вагітна малюком. Мінато і Кушина представляли спокійне життя батька і матір.
Одного разу його сенсей представив свою чергову книгу, головним героєм якої став ніндзя по імені Наруто. Мінато дуже сподобалося це ім'я і він зі своєю дружиною вирішив назвати свого майбутнього сина на честь героя цієї книги, що не на жарт здивувало Джірайя. Третя Світова Війна Шиноби
Після того, як Мінато отримав звання джонин він був призначений лідером Команди Мінато і став сенсеєм Хатаке Какаши. Учихи Оббито Ірина. Рін була Ірьyoнін. Оббите - членом легендарного Клану Учіха. а Какаши сином Сакумі Хатаке. Під час Третьої світової війни шиноби, Мінато став відомий ворогам як "Жовта блискавка Конохи". Какаші під час війни отримав звання джонин і отримав в подарунок від Минато особливий куна, трохи важче звичайного, але більш швидкий і гострий. Останньою місією команди на війні стало знищення моста канабах, щоб не дозволити ворожим шиноби переправитися до Конохи.
Так як Какаші був того ж звання, що і його сенсей, Мінато призначив його командиром команди, а сам відправився на іншу МІСД. Він без праці знищив ворожих шиноби з Івагакуре і завершив свою місію. Мінато переміщається до Куна, подарованому Какаши, і рятує його і Рін від шиноби Верби. З'ясовується, що Оббито загинув рятуючи їх від обвалу. Пізніше він разом з Какаші закінчують місію зі знищення моста канабах.
В невідомий момент на війні його загін зіткнувся з загоном Кумогакуре, в якому були Ей і Бі. Після безрезультатного битви Минато йде пообіцявши Ею, що вони зустрінуться ще раз після того як обидва отримають титул Каге.
Після закінчення війни, Сарутобі Хірузен призначив Минато Четвертим Хокаге, тому що знав, що він не залишить інших жителів села в біді і пожертвує своїм життям заради їх порятунку. Іншим кандидатом на пост Хокаге був Орочимару. але Сарутобі визнав його методи занадто небезпечними для управління села, що і змусило Саннін покинути її.
Битва з Тобі
Тобі вдалося вистежити місце пологів Кушина. Коли Кушина народжує сина, з'являється Тобі і вистачає Наруто. Тобі намагається пронизати новонародженого Куна, але Минато випереджає його з величезною швидкістю і вириває Наруто з його рук. Однак покривало новонародженого наділене вибуховими печатками. За допомогою своєї просторово-часової техніки, Мінато йде від вибуху, але Кушина залишається в приміщенні і повністю беззахисна. Мінато телепортирует Наруто додому і відправляється в пошуки Кушина. Тим часом, Тобі приковує Кушин до кількох колам за межами Конохи, витягує Кьюбі і підпорядковує його собі своїм Шарінґану. Кьюбі повинен вбити Кушина, яка пережила процедуру, однак Минато рятує її. Він відносить її до Наруто, а сам вирушає зупиняти Тобі. Поки Курама руйнує село, Тобі знаходить тільки що повернувся Мінато. Між ними починається бій, Тобі намагається відправити Мінато в інший вимір, тим самим занурити його в ілюзію, але швидкість Четвертого хокаге перевершує швидкість Тобі. Мінато використовує Расенган, поранивши Тобі, після чого той зникає. Пізніше стає відомо, що Тобі - його колишній учень Учіха Оббито. якому на той момент було 14 років.