Комплексна структура логістики туризму охоплює її компонентну, регіональну і функціональну структури.
До компонентної структурі відносяться:
1) логістика рекреаційно туристичних ресурсів (ресурсної бази туризму)
2) логістика матеріально-технічної бази туризму, в тому числі логістика сфер розміщення туристів (готельного господарства) і харчування (ресторанного господарства)
3) логістика інформаційної інфраструктури (інформаційна логістика в туризмі)
4) логістика транспортної інфраструктури туризму (логістика туристичних перевезень)
5) логістика екскурсійного обслуговування
6) логістика супутніх послуг в туризмі
7) логістика виробництва і збуту туристичних товарів
Регіональна структура логістики туризму відображає її регіональні системи шести рівнів:
1) локальний (логістика туру)
2) мікрорівень (логістика турфірми)
3) мезорівень (логістика туристичної і курортної зон туристичного району)
4) макрорівень (логістика туристичної галузі країни)
5) мегауровень (логістика туристичних макрорегіонів світу)
6) метауровень (логістика світового туризму)
Цілі і завдання логістики туризму на різних регіональних рівнях різні. Якщо впровадження логістичних принципів в управління турфірмою (мікрорівень) дозволяє скоротити витрати і таким чином підвищити ефективність діяльності туристичного підприємства та збільшити його прибуток, то застосування логістичних підходів на вищих таксономічних рівнях (мезо, макро) дає можливість забезпечити сталий розвиток туристичного бізнесу в межах туристично рекреаційної зони, області, країни. На мега- і метауровне регіональних логістичних систем туризму розглядають проблеми сталого розвитку туристичної галузі в масштабі туристичних макрорегіонів світу, виділяє Всесвітня туристична організація, і глобальні питання сталого розвитку туристичної індустрії.
Функціональна структура логістики туризму охоплює такі традиційні складові, як логістика постачання, логістика виробництва і збуту. Вони стосуються всіх складових як компонентних, так і регіональних систем логістики туризму.