Починаючи з XVI ст. Росія перетворюється на багатонаціональну державу. Російська армія, найважливіша складова російської державності, протягом наступної історії характеризується поліетнічністю і поліконфесійному. У військах Російської імперії особливе місце займали башкири, які сповідують Іслам.
За умовами добровільного входження Башкортостану до складу Росії в XVI ст. башкири, зберігаючи вотчинное право на землю, місцеве самоврядування та релігію - Іслам - повинні були нести військову службу. Башкирські кінні полки брали участь у Лівонській війні, в звільненні Москви від польських інтервентів 1612 р в Азовському поході Петра I, в Північній війні проти Швеції, в Семирічній війні в Німеччині (1756-1763) та інших війнах, які вела Росія.
Навіть після створення в Росії армії і флоту європейського зразка в епоху Петра I башкирські кінні полки представляли звичайну іррегулярне кавалерію - зі своїм внутрішнім статутом, зі своїм командним складом з числа башкирських же аристократів, тарханів і старшин, зі своїми військовими імамами.
Це пояснюється не тільки бажанням держави більш ефективно використовувати башкирську кінноту, а й слабкістю позицій Росії в Башкортостані в XVII-XVIII ст. Найчастіше участь башкирів в походах російської армії було своєрідною заміною покарання за їх участь в грандіозних повстаннях, стрясали Башкортостан в XVII і початку XVIII ст. Ці повстання були бурхливою реакцією башкир на їх поступове поневолення Російською імперією.
Башкортостан жив в стані перманентного непокори протягом трьох перших чвертей XVII в.
Башкирська тархан (князь) Алдар Ісянгільдіно, який брав участь в Азовському поході Петра I, був ідейним натхненником і одним з керівників башкирського повстання 1705-1709 рр. За його наказом були взяті приступом і зруйновані багато російські фортеці, знищені російські селища в басейні річок Біла, Кама і середній течії Волги. Він відомий також тим, що надавав великого значення будівництва в Башкортостані мусульманських шкіл-медресе, запрошував для роботи в них викладачів з Хіви, Бухари і Дагестану.
У Семирічній війні 1756-1763 рр. брали участь 15 тисяч башкирів в складі 12 полків під загальним керівництвом генерала Апраксина. Башкирські воїни проявили хоробрість у боях при Егерсдорфе-Гроссе поблизу Кенігсберга. Башкирські полки внесли істотний внесок у перемогу російського війська під керівництвом генерала Салтикова над прусським військом в битві при Куннерсдорфе неподалік від Франкфурта-на-Одері. У 1760 р генерал Чернишов тимчасово захопив Берлін. Башкирські полки перебували в перших рядах російської армії під час штурму і подальшого вступу в це місто. Для підтримки порядку в міських кварталах і охорони установ Берліна були виставлені башкирські патрулі, оскільки ісламський заборону на вживання спиртного забезпечував високу дисципліну башкирських воїнів.
Але не всі солдати-мусульмани в Російській армії володіли такою правовою захищеністю в області релігії, як башкири, які несли службу в иррегулярной кавалерії. За «Штатам армійських фузілерних полків 1765 г.», «Штатам польового піхотного полку 1732 г.», «Штатам піхотних полків 1765 г.» і т. Д. В кожному регулярному полку була передбачена посада попа. У стан державних селян, з якого комплектувалася армія, входили поряд з російськими і татари, які дотримувалися мусульманської релігії. Татари, як і чуваші і марійці, служили в російських регулярних частинах.
Як вже говорилося, башкири не несли службу в регулярній армії. Але в першій половині і в середині XVII ст. російська влада вже практикували в якості покарання за участь в башкирських повстаннях віддачу в рекрути, в так звані «остзейские» полки, розквартировані в Прибалтиці, і в матроси на Балтійський флот. Французький історик Роже Порталь в книзі «Башкирія в XVII-XVII ст.» Так пише про башкирською повстанні 1735-1740 рр. «Репресії, проведення яких було доручено полковнику Олексію (Котломухамету) Тевкелева, були надзвичайно жорстокими.
За свідченням начальника Комісії Башкирських справ генерала Саймонова, тільки в 1737-1740 рр. було спалено 880 башкирських сіл, тисячі жінок і дітей віддані в кріпаки, більше 500 башкир забриті в солдати, 300 зазнали прочуханки батогом і відрізання носа і вух. Після придушення башкирського повстання 1755 г. «тисячі башкирів засудили до покарання батогом, до примусових робіт на уральських заводах або в поміщицьких володіннях в Центральній Росії, інші віддані в армію або на Балтійський флот. Довгі колони колишніх бунтівників потягнулися не в Сибір, куди йшли всі каторжани, а на захід, втрачаючи при цьому по дорозі від знемоги і хвороб до 3/4 людей. Таким чином, для того, щоб значно полегшити проникнення Росії в Башкирію, владою застосовувалося масове винищення башкирського населення »(Р. Порталь. Башкирія в XVII-XVIII ст.).
Всі адміністративні особи кантонів і юрт (команд) ставали військовими. З башкир було сформовано іррегулярні військо, розділене спочатку на 11 кантонів, потім на 12, а згодом на 28. Кожен дорослий башкирів став козаком, зобов'язаним в будь-який день осідлати коня і виступити в похід. У разі участі Башкирського війська в походах Російської армії воно комплектувало п'ятисотенні полки, в яких за штатним розкладом передбачався військовий імам (полковий мулла). У командний склад башкирського козачого полку входили 30 осіб: командир полку, старшина, 5 осавулів, 5 сотників, 5 хорунжих, квартирмейстер, мулла, 1-2 писаря і 10 п'ятидесятників.
У 1806-1807 рр. в європейський похід Російської армії було відправлено башкирська військо з 20 полків. У війні 1812-1814 рр. проти Наполеона в складі Російської армії взяли участь вже 28 башкирських полків. В ході закордонного походу Російської армії башкири проявили хоробрість і мужність в боях під Лейпцигом, Веймаром, Ганновером, Данцигом в Німеччині, Шатобрианом і Парижем у Франції. Багато башкирські воїни були відзначені за героїзм бойовими орденами і медалями. У числі відзначилися воїнів були і башкирські жінки. Про хоробрість башкирських воїнів розповідає в своїх спогадах французький генерал де Марбо. Він був вражений безстрашністю башкир, які, маючи тільки холодна зброя, луки і стріли, атакували особистий конвой Наполеона і змусили відступити кращі французькі частини.
Зустріч великого німецького поета Гете з башкирськими воїнами в Веймарі посилила у філософа і поета інтерес до Сходу. Якраз в цей час хтось з німецьких дослідників привіз для нього з Іспанії Коран. Виконані прекрасним каліграфічним почерком рядки Корану привели Гете в захоплення. Він навіть спробував переписати аяти Корану, хоча, зрозуміло, арабської мови не знав. Гете розпорядився, щоб йому перевели на німецьку мову Святе Письмо мусульман. Сам він в ті дні зачитувався віршами великого іранського поета Гафіз в перекладі на німецьку мову. І поява башкир в Європі було як буквальне пришестя Сходу в Веймар. Башкири виконували колективну молитву (салят аль-джама'а) в Веймарської гімназії. На одній з них був присутній і сам Гете. Можливо, що це була святкова молитва (салят аль-'ід), і поетові захотілося подивитися на відправлення мусульманського обряду богослужіння, Серед башкир був один офіцер високого чину, якого вони називали принцом. Гете зустрівся з ним. Коли башкири відвідали Веймарський театр, Гете виступив з вітальним словом, а ті, в свою чергу, подарували йому бойовий лук зі стрілами.
З великим жалем доводиться відзначати, що сьогодні деякі люди, далекі від історичного знання, виявляють абсолютно недоречний захват з приводу прояву башкирами хоробрості і мужності у війні проти Наполеона. Башкирському народу переклад його в військово-козацьке стан приніс незліченні страждання. За наказом царських генералів башкирські частини кидалися в саме пекло таких кровопролитних битв, як Бородінська війна 1812 г. «битва народів» під Лейпцигом 1813 і несли великі втрати. Якшігул Янсуров, військовий імам однієї з башкирських полків, відправив з Парижа башкирському Тарханов Мусі кучуковая лист з нижченаведеними віршованими рядками: «Про провидіння, ти розлучив нас з батьківщиною для стогонів. // Сто тисяч бід відчуваємо ми кожен день, щоб повернутися в цілості. // Ми, сподіваючись на Бога, довірили Йому свої голови .// Що дивного, якщо небесні ангели будуть нам супутниками? »
У 1862 р Башкирське військо і військово-кантональна система управління башкирами були скасовані. Тепер башкири служили в російських частинах, де не було полкових мулл, що надзвичайно ускладнювало їм виконання мусульманських релігійних обов'язків. Батько відомого тюрколога і засновника Башкирської республіки Заки Валід Тогана (1890-1980) башкирський сільський мулла Ахматшах в молодості служив у російській частині в Гунібі (Дагестан).
Як відомо, мусульманину, випробував полюції (іхтілам), покладається зробити повне обмивання (гуслі). Але коли Ахматшах здійснював вночі повне обмивання, його застав черговий російський офіцер. Не розібравшись, у чому справа, командир частини піддав башкирського солдата важкого покарання. Виручив його командир дагестанського роти, забравши Ахматшаха на час в свою частину. Оскільки батько Заки Валід не знав російської мови, він розмовляв з дагестанським офіцером по-арабськи, і той був вельми задоволений. Ахматшах під час служби в Гунібі познайомився з колишнім писарем імама Шаміля і аж до революції 1905 р листувався з ним і його братом по-арабськи. Після закінчення служби Ахматшах залишився в Дагестані на рік і продовжив вивчення арабської мови.
Як випливає з вищевикладеного, положення солдат-мусульман в Російській армії в XVII-XIX ст. було неоднозначним. Російське командування, дозволяючи солдатам-мусульманам в регулярній армії сповідувати Іслам, проте будь-якими засобами заохочувала прийняття військовослужбовцями-мусульманами православ'я. Правове становище військовослужбовців-мусульман в иррегулярной кавалерії було незрівнянно краще. Держава сприяло Ісламу, передбачаючи в башкирських полицях посаду військового імама. Тим самим забезпечувалася боєздатність башкирських військових частин.