Дрібний ендодонтичний інструментарій поміщають на 30 хв і більше в різноманітні ендодонтичні антисептичні розчини:
- потрійний розчин (20 мл формаліну, 3 г карболки (карболової кислоти), 15 г карбонату натрію, 1000 мол води дистильованої);
- розчин, що складається з трьох частин етилового спирту і однієї частини формаліну;
- 1% розчин хлоргексидину;
- четвертинні амонієві сполуки у вигляді розчинів - 0,1% розчин бензалконіум хлориду з 0,1-0,25% Цетримід (антибіотик), розчин 0,15% декаметоксина і ін.
Гутаперчеві і срібні штифти перед вживанням також можна піддавати холодної стерилізації. Для цього їх занурюють в якійсь із антисептичних розчинів (краще в розчин 0,15% декаметоксина), а перед пломбуванням висушують. Шляхом холодної стерилізації можна обробляти скла, призначені для замішування цементу, а також чашки Петрі.
Варто відзначити, що в стоматології піддається холодної стерилізації тільки багаторазовий інструментарій. Більшість ендодонтичного інструменту сьогодні є одноразовим, тобто вже стерильним, що не вимагає додаткової обробки агресивними середовищами. Останні несприятливо впливають на стоматологічні матеріали та можуть призвести до їх пошкодження. Наприклад, культевая вкладка, вартість якої хоч і не висока, але все ж може після холодної стерилізації агресивними дезрастворе втратити свої первинні властивості.
У спеціальних ендодонтичних кабінетах повинні бути стерильні столики, де весь ендодонтичний інструментарій та перев'язувальний матеріал, підданий стерилізації, в обов'язковому порядку розкладають в заздалегідь заданому порядку.
Після стерилізації інструменти зберігають в чашках Петрі не більше 1 тижня. При іншому способі зберігання інструменти можна розкласти по окремим скляних банках з притертими кришками, що містять чистий етиловий спирт або суміш з трьох частин спирту і однієї частини формаліну. Стерильні ватяні кульки і турунди на ендодонтичних кореневих голках і дрильбори до вживання зберігають в чашках Петрі або в пеніцилінових флаконах, а ватяні валики - в закритих біксах. У зв'язку з тим що важко зберігати стерильність перев'язувального матеріалу з-за частого відкривання бікс протягом дня, рекомендується упаковувати ватяні кульки, валики і ватяні турунди в паперові пакети і стерилізувати в автоклаві. Кожен пакет розрахований на одного хворого і містить 10-15 ватних кульок або таку ж кількість ватних валиків і турунд; інші пакети слід зберігати в бікси. При такому способі упаковки стерильність перев'язувального матеріалу зберігається протягом 1 тижня. незважаючи на щоденне багаторазове відкривання бікс.