Бактерії відіграють важливу роль на Землі. Вони - важлива ланка круговороту речовин. Вони беруть участь в тому ж круговороті речовин в природі, формуючи структуру і родючість грунту (викликають гниття загиблих рослин і тварин). Беруть участь в різних процесах: розкладання складних речовин до більш простих (наприклад, азотфіксуючі бактерії), гниття, в руйнуванні корисних копалин. Також використовуються в харчовій, мікробіологічній промисловості.
Ціанобактерії при фотосинтезі виділяють кисень. Саме завдяки цій групі організмів приблизно 2 мільярди років тому в атмосфері почалося накопичення молекулярного кисню. В результаті діяльності цих бактерій змінився газовий склад атмосфери і сформувався озоновий екран. Важливу роль відіграють бактерії в фіксації атмосферного азоту. Бактерії відіграють велику роль в біологічно важливих круговоротах речовин на Землі, здійснюючи хімічні перетворення, недоступні ні рослинам, ні тваринам. Сапротрофного бактерії забезпечують розкладання складних органічних речовин, переводячи їх в мінеральні сполуки, які можуть засвоюватися рослинами. В результаті діяльності сапротрофних бактерій Земля очищається від трупів тварин і рослин. Таким чином, бактерії є іажним ланкою кругообігу речовин в природі, а також санітарами нашої планети. Без діяльності бактерій життя на Землі було б неможливе.