Метод ІКСІ дозволяє бути батьками чоловікам з низькими якісними і кількісними показниками сперми або непрохідності шляхами. Більшість методів штучного запліднення спочатку були випробувані на тваринах. Але ІКСІ не працює на тварин. Метод ІКСІ був відкритий випадково - лаборант помістив сперматозоїд прямо на захисну оболонку яйцеклітини, а не під неї. У наш час велика частина «дітей в пробірці» в США зобов'язана своїм існуванням методу ІКСІ. Настільки швидке впровадження цього агресивного методу викликає заклопотаність у фахівців. Чи не зашкодить необхідна для ІКСІ ін'єкція процесу поділу клітин? Чи не поширить даний метод проблеми безпліддя на наступні покоління? Адже цілком можливо, що дефекти, які викликали чоловіче безпліддя, є лише невеликою частиною спектра генетичних патологій, які розповсюджуються цієї нездорової спермою. Імовірність появи вроджених вад у дітей, зачатих за допомогою методу ІКСІ і інших екстракорпоральних методів, становить 9% проти 4% для дітей, зачатих природним шляхом. Ці дані отримані австралійськими вченими. Згідно зі статистикою американських дослідників, ймовірність народження дітей зі зниженим вагою і більш схильних до інфекцій в 2,5 рази вище в разі штучного зачаття.
Хоча ці результати зараз оскаржуються науковою громадськістю, проблема все ж існує. В Англії дозволяють впроваджувати в матку не більше ніж 2 ембріона - багатоплідна вагітність дуже небезпечна і для матері і для зародка.