Основні напрямки наукової та педагогічної роботи Археографічної лабораторії пов'язані з історією рукописної та стародруків слов'яно-руської книги, книжності і культури пізнього українського середньовіччя як основи духовного життя всіх верств українського суспільства, держави і церкви. Співробітниками лабораторії, вивчили унікальний архів Московського друкованого двору, була принципово переглянута історико-культурна роль Московського друкованого двору. Співробітники лабораторії розробили методику поекземплярного джерелознавчого опису збережених друкованих видань. В рамках багаторічних програм вони ініціювали і в значній частині виконали за допомогою студентів історичного факультету МДУ і підготовлених на місцях фахівців опис регіональних зборів кириличної книжності в Тверській, Ярославській і Пермської областях і фондів ряду бібліотек: Наукової бібліотеки МДУ, Московських Духовних училищ, Свято-Троїцької Лаври, М.І. Чуванова і ін. Метод паралельного дослідження архіву Московського друкованого двору і інформації, виявленої на збережених примірниках його видань, дозволили довести, що вже в першій половині XVII ст. Московський друкарський двір був найважливішим фактором української культури і державності.
Співробітниками Археографічної лабораторії в різні роки були організовані кілька виставок, присвячених традиційної книжкової та духовній культурі досліджуваних районів.
Археографічна лабораторія ініціює і проводить роботу по програмі «МГУ - української провінції», мета якої - опис в районах, де відсутні фахівці, рукописних і друкованих кириличних книжкових пам'яток в державних сховищах, і на цій базі підготовка місцевих кадрів археографів. Така робота ведеться з науковими та просвітницькими організаціями Тверській, Ярославській, Пермської областей.
Археографічна лабораторія - провідна організація в секції «Рідкісна книга» ЦБІК Міністерства освіти РФ. З її ініціативи і під її керівництвом спільно з Головархівом і Міністерством культури України проведено кілька Всеукраїнських шкіл підвищення кваліфікації співробітників бібліотек, музеїв та архівів РФ. Ці школи збирають співробітників державних установ десятків районів країни і стали помітним явищем у вирішенні проблеми підготовки кадрів археографів.
Лабораторія працює в тісному контакті з Археографічної комісією РАН, багаторічні ділові відносини має з Центром середньовічних слов'янських досліджень Головної бібліотеки університету м Колумбус штату Огайо і Сіландарскім центром того ж університету.