Андижанський державний медичний інститут є одним з провідних вищих навчальних закладів Узбекистану. Випускники інституту працюють в лікувальних установах у всіх регіонах республіки і за кордоном.
В інституті готуються медичні кадри в факультетах - лікувальної справи, педіатричному, медичної педагогіки, медичної сестри вищої кваліфікації. А також функціонує факультет підвищення кваліфікації лікарів.
В інституті навчаються магістри за напрямками: внутрішні хвороби, кардіологія, хірургія, акушерство і гінекологія, урологія, педіатрія, психіатрія, дитячі інфекційні хвороби, онкологія, нейрохірургія і дитяча хірургія.
Кафедри розташовані в клініці інституту і в інших лікарнях обласного управління охорони здоров'я, які оснащені сучасними технічними засобами. Клініка інституту розрахована на 700 ліжок, де використовується і сучасне діагностичне обладнання. В інституті діють республіканські Центр вертебрології, лимфологии і Кардіохірургії.
Випускники інституту проходять навчання в аспірантурі за спеціальностями: акушерство і гінекологія, анатомія, ЛОР, внутрішні хвороби, кардіологія, педіатрія, шкірні та венерологічні хвороби, лікувальна фізкультура і спортивна медицина, травматологія та ортопедія, фармакологія, рентген-діагностика та рентген-терапія, психіатрія , нейрохірургія і докторантурі за напрямками хірургія та нейрохірургія.
Інститут має всі умови організації навчального процесу та науково-дослідної роботи на високому рівні. У центральній науково-дослідній лабораторії інституту ведуться дослідницькі роботи з гастроентерології та сучасної імунології. Для наукових експериментів існує віваріум.
Ведуться спільні роботи з міжнародними організаціями в галузі охорони здоров'я та наукових досліджень.
Вчені інституту проводять науково-дослідну роботу за наступними напрямками: лікування серцево-судинних захворювань; лікування хронічної виразки дванадцятипалої кишки; захист здоров'я матері і дитини; вивчення морфологічних змін внутрішніх органів у ембріона, новонародженого і у людей різного віку; нові технології в області лімфотерапіі; лікування вірусного гепатиту і гострих кишкових захворювань; лікування хронічних неінфекційних і серцево-судинних захворювань.