Як вже було раніше сказано, Шепард, після нападу колекціонерів у другій частині Mass Effect, не встиг евакуюватися з корабля "Normandy SR1" і загинув від задухи, але тіло нещасного героя було ще занадто рано списувати з рахунків. На щастя опинилися в цьому районі дослідні кораблі "Цербера" натрапили на останки героя Альянсу, що врятував Цитадель від неминучої загибелі, який зупинив вторгнення Гетов в земну систему і тд і тп. Тіло вони відшукали за допомогою спеціальних зондів (космічних дронів), ясна річ ніхто з екіпажу Спеціально не визирав крізь ілюмінатор щоб упевнитися в тому, а чи не летить там трупак знаменитого капітана! Ну і Привид ясна річ зметикував, що оскільки корабель Шепарда належав альянсу тепер - купа уламків, то послав на цю планету експедицію з професійних вчених і інженерів можна скласти креслення для майбутньої Нормандії SR2, частина креслень модифікацій корабля ясна річ була вкрадена з архівів Альянсу (у примари - глави таємницею науково-дослідницької організації Цербер всюди були свої люди) до того ж на щастя в його руках опинився сам командор Шепард. Якому просто пощастило опинитися в потрібному місці в потрібний час. Я маю на увазі, що тільки завдяки високим досягненням тодішньої нейрохірургії, трансплантології, нейро-біології, генетики та фізіології - стало можливим відновлення тіла Шепарда. Опускаючи непотрібні подробиці про те, як тіло переходило з рук в руки (можете самі про це прочитати на дозвіллі) перейду до основного.
Завдяки карколомної красуні і главі Цербера - Міранді Лоусон (чий образ був узятий з чудовою актриси чиє ім'я Yvonne Strahovski і не менш милою.
Ліара Т.Соні (чиє обличчя схоже на Джилліан Мюррей) а образ був узятий з Чіани з серіалу "На краю світу" (див нижче).
- тіло капітана Шепарда потрапило до Привида на науково-дослідну станцію "Лазар". Це було єдине місце у Всесвіті де труп могли повернути з того світу, перетворивши його в свого роду кіборга (на кшталт того, що ви вже бачили в недавньому фільмі Робокоп, тільки ще крутіше). Крім біологічного воскресіння капітану також повинні були повернути пам'ять і бойові можливості, а ще вживити чіп (це вже за повідомленнями Міранди на Цитаделі, багато пізніше). Але від останнього (за указом Примари) вирішено було відмовитися, хоч як це і не типово прозвучить - на цьому наполягала офіцер Лоусон. Але не судіть її суворо. За той час що вона пробула біля мертвого капітана, вона буквально стала бачити в ньому саму себе і перейнялася до нього небувалим сочуствую. Її геном точно також колись був створений в лабораторії завдяки зусиллям її батька Генрі Лоусона - впливового бізнесмена і талановитого вченого. Він хотів зробити свою дочку генетично досконалої в усьому. Все від того як виглядає Міранда, включаючи її здатності і можливості, було вкладено в її ген ще задовго до її народження за допомогою генетичних маніпуляцій на молекулярному рівні. Завдяки цьому Мірі стала дійсно чарівниченьком, та до того ж отримала подовжений термін життя, над-здатності включаючи регенерацію тканин і першокласний спритність з допитливим розумом. Однак був у цих поліпшень побічний ефект - доброякісна пухлина яка розвинулася з часом і через яку Мірі не може мати дітей. Загалом, у неї була маса приводів для того, щоб перейнятися співчуттям до померлого, який з кожним днем перетворювався в кіборга завдяки своєму першокласних керівнику проекту, якою була Міранда, і свого лікаря Вілсона - майстерності якого не було меж. Через два роки Шепард після молекулярних і хірургічних маніпуляцій, а також імплантації кібернетичних імплантантів, котрі допомогли відновити його тіло - нарешті прийшов до тями, а Мірі опинилася по близькості здивувалася цьому не менше доктора. Правда Шеп майже відразу знепритомнів і впав в кому, сильно налякавши Мірі, яка вирішила що Кепу погано. Насправді Вілсон намагався провернути саботаж, тому як таємно працював на сірого посередника (ні, не на Ліара, на іншого, того, чиє місце вона займе пізніше). Через деякий час Шепард знову прийшов до тями і сталося це приблизно в той же час, коли Вілсон остаточно закінчив планування диверсії. Він підняв охоронних роботів на боротьбу з Мірандою, сподіваючись на те, що ті зуміють затримати керівницю проекту, а він за цей час встигне потай від неї викрасти капітана і доставити його до С.П. Шепард, збігаючи з лабораторії, наткнеться спершу на Джейкоба Тейлора, чий образ перейшов від Кеніоном Гловера - актора, продюсера і режисера.
Вирішивши не баритися - Лоусон разом з Тейлором і Шепард вирушили на прийом до примарі, по дорозі Міранда задала йому кілька запитань щодо його минулого життя щоб перевірити чи повернулася до нього пам'ять. Добравшись до звичайно пункту призначення, Шеп практично відразу відправився в приймальню засновника і голови Цербера. Той, умовно кажучи, "промив йому мізки" своєю турботою про людство. Розповів про напад женців на систему Терміну, де все населення разом безслідно зникало при загадкових обставинах (насправді за цим стояли колекціонери працюють за вказівкою женців). Так чи інакше Привид зумів підібрати такі слова до капітана, що він всерйоз повірив, що альянсу на ці проблеми глибоко і далеко. а Церберу навпаки це важливо для "порятунку людства" і придбання нових технологій. Та до того ж бачачи технічну перевагу своїх воскресителя і нових наймачів. Шепард недовго думав, коли Привид запропонував йому працювати на нього самого і погодився співпрацювати. Вдячний такому щедрому жесту - Привид повернув Шепард його Нормандію, на цей раз охрещений SR2 з новими модифікаціями і штучним інтелектом на ім'я Сузі. В команду екіпажу корабля увійшли оперативники "Цербера" - Міранда Лоусон і Джей Тейлор. Ах да, на місце пілота повернувся Джокер, ну і не обійшлося без професійного доктора - Чаквас.
Корабель Нормандія з Mass Effect швидше за все є наступником Ангеллади з гри Nexus: інцидент на Юпітері. Тому як: обидва корабля оснащені штучний інтелект (ШІ) у випадку з Нормандією - Сузі, на Ангелладе - Ангел, на обох крейсерах системою маскування управляє ІІ, обидва кораблі мають системою сканування і двигунами на антиматерії, у випадку з Нормандією (нульовий елемент). Обидва корабля можуть вмістити дві десантних шлюпки для висадки на планету або кілька файтери (невеликих бойових винищувачів). Обидва корабля під час бою здатні поглинати енергію зарядів і зберігати її в резервних батареях. Обидва корабля здатні емулювати (адаптувати нові технології) і можуть здійснювати гіперстрибок в космічному просторі. Швидкість Нормандії звичайно вище швидкості Ангеллади, але вона не поступається їй за живучості. На відміну від SR1,2 - Ангеллада здатна регенерувати без участі людини, тому що вибудувана на біологічній основі, склад якої не вивчений. Обидва корабля мають солідним лазерним і торпедним озброєнням і брали участь у порятунку Землі. Також в обох крейсерів ангар знаходиться прямо посередині корпусу і обидва мають кінетичними бар'єрами.
Повертаючись до Шепард і його команді - піднявшись на борт Нормандії він вперше зустрівся з ще однією цікавою особистістю. Мова йде про Келлі Чамберс. Образ Келлі швидше за все був узятий з Мілен Фармер (див.вище) французької актриси, співачки і поетеси. Познайомившись з нею, Шеп з'ясував, що вона його особистий секретар приставлений Примарою, а також психолог, який відповідає за емоційне самопочуття екіпажу. Після того як Шеп освоївся на кораблі - Привид відправив його на перше завдання, на колонію під назвою "Шлях Свободи" (останнє місце таємничого зникнення людей). Тут виявилися докази, які розкрили участь в цьому колекціонерів. Це була раса протеан (перекручена женцями) і зачищала колонії вона за наказом женців. Чиїх метою було - знищення і поневолення всіх існуючих рас досяг стелі в розвитку цивілізації, з метою завершення циклу еволюції. Правда про це стане відомо тільки в третій частині гри. А до того часу - для боротьби з загадковими колекціонерами Привид запропонувати зібрати більш серйозний бойовий загін, здатний покінчити з загрозою людству раз і назавжди. Про те які найманці доповнили екіпаж Нормандії і образи яких акторів були взяті з реального життя для їхніх облич - буде описано в наступній частині.