Головною умовою зберігання сої вважається зменшення вологості зерна до рекомендованого рівня. Це допоможе зберегти сировину від впливу хвороботворних бактерій, грибка, а також знизити інтенсивність газообміну. При недовгому зберіганні вплив газообміну (призводить до виділення деякої кількості тепла) НЕ берет в облік, але цим процесом не варто нехтувати, якщо соя закладається в сховище на місяць або більше.
В процесі зберігання тепло накопичується в центральній частині насипу, повільно піднімаючись догори. У разі, розміщення великого обсягу сої тепло буде накопичуватися до досягнення можливого теплообміну, який відбуватиметься через стінки споруди. У подібній ситуації необхідно зменшити вологість зерна до 13%, а також охолодити його до потрібного рівня перед закладенням на зберігання. З цього можна зробити висновок, що мінімальна температура в зерновому бункері запобіжить розвитку хвороб сої, а також стримає розвиток грибка.
Основною причиною втрати якості сої вважається присутність грибкових захворювань. Помічено, що подібні хвороби не проявляються при зменшенні температури до 5 градусів тепла, вологості не більше 14%. Вологість повітря при зберіганні сої повинна бути не більшою від 65%. При довготривалому збереженні значних обсягів сої потрібно передбачити систему вентиляції в приміщенні. Штучне провітрювання сховища дозволить видалити зайву вологу, попередить процеси горіння зерна і розвиток грибкових захворювань. Для кращого збереження слід звести до мінімуму кількість бур'янів домішок в насінні. Також необхідно зменшити кількість травмованих і мають тріщини зерен.
Як ми вже говорили для якісного та тривалого зберігання насіння сої потрібно дотримуватися таких вимог:
- вологість зерна в межах 10-11%;
- температурний режим в сховище від -5 до +5 градусів;
- вологість повітря в приміщенні менше 65%.
- відсутність шкідливих домішок і неякісного матеріалу в насінні.
Одним із сучасних способів зберігання сої вважається використання об'ємних поліетиленових мішків, в які вміщається до 250 тонн сировини. Укладають таку тару з зерном на відкритій місцевості. Вони складаються з декількох шарів поліетилену, які оберігають зерно від проникнення хвороботворних мікроорганізмів. Перевагою даного способу вважається економія фінансових коштів приблизно на 35% в порівнянні з використанням складських приміщень або бункерів, а також мінімальний вплив погодних умов, що досягається через високий ступінь герметизації тари. Зауважимо, що такий спосіб придатний для зберігання продовольчого і кормового зерна.
Протягом всього часу зберігання ведеться спостереження за вологістю зерна, зміною його кольору і запаху. У разі виявлення зміни якостей сировини насіння підсушують, після чого зменшується температура всередині сховища.