В силу багатьох причин і обставин монастир постійно знаходився в тяжкому становищі, а в 1764 році за указом імператриці Катерини II був віднесений до позаштатним та через брак коштів повинен бути закритий. Але промислом Божим графиня Орлова-Чесменська (в чернецтві - Агнія) приймає підстриг і виділяє значну суму вкладу у багато монастирів на поминання душі, в числі яких виявляється і наш монастир. Отримавши 5000 золотих рублів, монастир продовжує своє існування.
Відродження і справжнє благоустрій обителі почалося з 1859 року, коли працями досвідченого духівника і вмілого господарника ігумена Іони (1859-1861 рр.) В монастир, з ласки Божої, стали надходити рясні пожертвування. При наступників архімандрита Феодосія (1861-1885 рр.) І Віталія (1888-1900 рр.) Були підняті з руїн перебували в запустінні після частих пожеж будівлі і споруди, а головне зведені нові кам'яні храми, братські корпуси, господарські та підсобні будівлі, так що до 1910 року в монастирі налічувалося шість храмів.
Частим гостем і щедрим благодійником обителі в кінці ХІХ - початку ХХ ст. був святий праведний пресвітер Іоанн Кронштадтський. Щорічно, під час своїх поїздок на батьківщину в село Сура, розташоване від с. Веркола на 50 км вище по річці Пінеге, він зупинявся в добре відомому йому з дитячих років Веркольскій монастирі і брав участь в богослужіннях. Їм особисто написаний чудовий акафіст святому юнакові Артемію. А в 1897 році при великому скупченні прочан Кронштадтський пастир освятив побудований на пожертвування їм кошти величний собор в Веркольскій обителі, яка багато в чому завдяки його ретельності стала справжньою прикрасою всього Північного краю.
Все це сприяло насадженню та утвердження в обителі строгих правил чернечого гуртожитку, особливо в церковному богослужінні.
Після громадянської війни монастир не уникнув загальної долі і був закритий богоборческими владою. Частина монастирської братії пішла. забравши з собою святині обителі. Мощі прав. отрока Артемія були завчасно заховано братією від наруги. В даний час їх розташування не відомо. Надбрамний храм з дзвіницею, кам'яна стіна навколо обителі і багато споруд були потім розібрані, а що залишилися споруди використовувалися не за прямим призначенням. Від повного руйнування монастир, з ласки Божої, врятували малонаселенность навколишньої місцевості і віддаленість від великих сіл і міст.