У павуків розвинулося внутрішнє запліднення, яке супроводжується або сперматофорним осіменінням, або каплиці (у більш розвинених форм).
Сперматофор - це мішечок, який виділяє самець, де знаходиться насіннєва рідина, захищена від висихання під час перебування на повітрі. У лжескорпіонов і деяких кліщів самці залишають сперматофор на грунті, в свою чергу самка захоплює його зовнішніми статевими органами. При цьому, самець і самка роблять «шлюбний танець» з різноманітних поз і рухів.
У багатьох павукоподібних самці переносять сперматофор в статевий отвір самки за допомогою хелицер. У деяких форм взагалі відсутня сперматофор, а є тільки копулятивні органи. Іноді для каплиці служать частини тіла, які не пов'язані зі статевою системою.
Багато павукоподібні відкладають яйця. У лжескорпіонов, деяких кліщів, скорпіонів спостерігається живородіння. В основному, яйця великі і багаті жовтком.
У павукоподібних різні види дроблення, але в більшості випадків зустрічається поверхневий дроблення. Зародковому смужка утворюється за рахунок диференціації. Поверхневий шар зародкової смужки утворений ектодермою, а мезодерма являє глибші шари. Ентодерма - це найглибший шар, який прилягає до жовтка. Інша частина зародка одягнена ектодермою. Тіло зародка формується за рахунок зародкової смужки.
В подальшому розвитку важливо відзначити, що сегментація у зародків може бути краще, з великого числа сегментів полягає тіло. З 12 сегментів складається черевце зародків у павуків. При подальшому розвитку все черевні сегменти зливаються воєдино, тим самим, утворюючи цілісне черевце.
Кінцівки у скорпіонів закладаються на 6 сегментах переднебрюшія. Статеві кришечки дає їх передня пара, друга пара - борін органи, з утворенням легким пов'язаний розвиток інших пар. Все це вказує на те, що клас членистоногі походить від предків, у яких була багата сегментація.