Прискоренню процесу створення і функціонування автономних установ, в тому числі на федеральному рівні, перешкоджає ряд факторів, в тому числі невиправдано складна процедура створення автономних установ (потрібне прийняття Урядом Укаїни індивідуальних рішень по кожній установі) і побоювання керівників більшості бюджетних установ з приводу організаційних та інших труднощів, пов'язаних з переходом в автономне установа. Відповідно закріплені в Законі про автономні установах правові механізми не були реалізовані на практиці, що не дозволило вирішити проблеми оптимізації бюджетної мережі.
Автономне установа за чинним законодавством відповідає за своїми зобов'язаннями усім, хто знаходиться у нього на праві оперативного управління майном, за винятком особливо цінного рухомого майна, закріпленого за автономним установою власником цього майна або придбаного автономним установою за рахунок виділених таким власником коштів, а також нерухомого майна.
Доходи від приносить дохід діяльності надходять в безпосереднє розпорядження автономного установи. Автономне установа в установленому порядку має право відкривати рахунки в кредитних організаціях. Фінансове забезпечення діяльності автономного установи здійснюється у формі субсидій на відшкодування нормативних витрат, пов'язаних з наданням ними державних (муніципальних) послуг громадянам та організаціям.
Автономні установи не є учасниками відносин у сфері розміщення державних (муніципальних) замовлень.
У кожному автономному установі створюється наглядова рада у складі не менше ніж п'яти і не більше ніж одинадцяти членів. До складу наглядової ради автономного установи входять представники засновника автономного установи, представники виконавчих органів державної влади або представники органів місцевого самоврядування, на які покладено управління державним або муніципальним майном, і представники громадськості, в тому числі особи, які мають заслуги і досягнення у відповідній сфері діяльності.
Наглядова рада є певним буфером у відносинах між керівником автономного установи і його засновником. Наявність наглядової ради в числі органів управління автономного установи багато в чому пояснює небажання керівників діючих установ змінювати тип діючих установ, так як повноваження наглядової ради зводять нанівець самостійність керівника установи, у веденні якого залишається тільки питання підписання документів, представлених засновником і розглянутих наглядовою радою установи.
Однак для початку його роботи необхідно прийняття близько 80 правових документів федерального і регіонального рівнів. Так, органам державної влади суб'єктів Укаїни необхідна розробити нормативні документи: про затвердження умов та порядку формування державного завдання і порядок фінансового забезпечення виконання цього завдання бюджетними установами суб'єктів Федерації (в тому числі муніципальними); про порядок визначення видів особливо цінного рухомого майна, щодо бюджетних установ суб'єктів РФ; про порядок прийняття рішення про створення бюджетного і казенного установи суб'єкта Україна в результаті його установи; про порядок затвердження статуту бюджетного і казенного установи суб'єкта Україна і про порядок внесення змін до нього; про порядок прийняття рішення про реорганізацію та ліквідацію (і порядку її проведення) бюджетних і казенних установ; про порядок зміни типу бюджетної установи суб'єкта Україна з метою створення казенного установи, а також зміни типу казенного установи суб'єкта Україна з метою створення бюджетної установи і т.д. Тільки після затвердження всіх зазначених документів можливо буде дати оцінку ефективності прийнятого закону, його можливості вирішити назрілі проблеми в області роботи державних установ в Укаїни.
В даний час законодавство передбачає два варіанти створення автономних установ: або шляхом установи, або шляхом перетворення з державного (муніципального) унітарного підприємства / державної установи.
Створення автономного установи «з нуля» відбувається на підставі рішення відповідного органу управління, в підпорядкуванні якого знаходиться дане автономне установа. В цьому випадку рішення про створення автономних установ федерального підпорядкування приймає Уряд РФ, а рішення по створенню автономного установи, що знаходиться в підпорядкуванні суб'єкта Україна або муніципального освіти, приймає відповідний суб'єкт РФ / муніципальне утворення.
Якщо ж в автономне установа перетворюється державне або муніципальне установа, то рішення має бути прийнято саме тим відповідним органом, у підпорядкуванні якого вони перебувають.
Згідно п. 3 постанови № 662 федеральний орган виконавчої влади здійснює функції і повноваження засновника федерального автономного установи. Також він здійснює поточний контроль за фінансово-господарською діяльністю федерального автономного установи.
Органом управління, що здійснює керівництво поточною діяльністю федерального автономного установи, є його керівник (виконавчий орган), який призначається на посаду за рішенням федерального органу виконавчої влади, що здійснює функції і повноваження засновника федерального автономного установи. На підставі ч. 2 ст. 8 Закону № 174-ФЗ в федеральному автономному установі вищим органом управління є наглядова рада, а також інші необхідні органи управління, пов'язані з галузевою специфікою федерального автономного установи (ст. 10 Закону № 174-ФЗ).
У федеральному автономному установі - академічному театрі драми - є такі керівні органи: генеральний директор, призначений на посаду Міністерством культуриУкаіни, наглядова рада з 7 осіб (відповідає за керівництво питаннями фінансово-господарської діяльності, схвалення значних правочинів, стверджує і контролює виконання програми діяльності і т .п.), художня рада (відповідає за репертуар театру) і піклувальна рада (спонсори та інвестори). Всі перераховані вище органи управління і їх повноваження відображені в статуті федерального автономного установи.
Автономне установа, незалежно від рівня підпорядкованості, наділяється майном, необхідним для виконання ним своїх функцій. Власником даного майна є РФ, суб'єкти Україна і муніципальні освіти. Відповідно до ч. 1 ст. 3 Закону № 174-ФЗ майно закріплюється за автономними установами на праві оперативного управління. Однак це не означає, що автономне установа взагалі не розпоряджається ніяким майном і навіть канцелярські товари воно повинно списувати тільки після отримання схвалення від засновника. Автономне установа не може розпоряджатися таким майном:
нерухомим майном, закріпленим за автономним установою засновником або придбаним засновником в централізованому порядку або ж на умовах централізованого фінансування;
земельними ділянками, отриманими автономним установою на праві безстрокового користування;
особливо цінним рухомим майном, відчуження якого здійснюється в спеціальному порядку (наприклад, музейні фонди);
особливо цінним рухомим майном, без якого автономне установа не зможе здійснювати свою діяльність;
Спортивно-оздоровчий комплекс є автономним установою, що перебуває в підпорядкуванні суб'єкта РФ. У статуті даного автономного установи зафіксовано, що особливо цінним є рухоме майно вартістю від 100 тис. Руб. до 500 тис. руб. Таке формулювання не суперечить нормі постанови № 538.
нерухомим майном, придбаним автономним установою за рахунок власних коштів, або ж вказане в ст. 3 Закону № 174-ФЗ «нерухоме майно, яке не належить до закріпленого за установою засновником (власником)». Але таке в принципі неможливо, так як видається сумнівним, що будь-яка юридична або фізична особа подарує автономному установі об'єкт нерухомості.
Однак напрями витрачання виручки, отриманої за рахунок надання автономним установою платних послуг, повинні бути закріплені в його статуті;
матеріальні запаси, придбані автономним установою для забезпечення своєї поточної діяльності.
Автономне муніципальне установа - дитяча та юнацька спортивна школа - набуло за рахунок здійснення позабюджетної діяльності колишню базу відпочинку підприємства під літній спортивний табір. Дана база буде вважатися власністю автономного установи, так як грошові кошти на її придбання засновником не виділялися.
Засновник (власник) також може вилучити знаходиться в оперативному управлінні або безстроковому користуванні (це земельні ділянки) майно у автономного установи. Процедура вилучення може бути «запущена» в тих випадках, коли автономне установа не використовує виділене йому майно.
Автономному установі - вищому навчальному закладу, що знаходиться у федеральній власності, - була виділена земельна ділянка розміром 2 га для створення навчально-виробничої бази. Однак автономне установа його не використав і земельну ділянку простоював. Після проведення перевірки фінансово-господарської діяльності було виявлено факт неефективного використання даного об'єкта ввіреного федерального майна і за рішенням федерального органу виконавчої влади земельну ділянку було вилучено.