Для визначення колі-індексу використовують метод мембранних фільтрів або безпосередній посів різних кількостей досліджуваного матеріалу на щільні поживні середовища. Суть методу мембранних фільтрів полягає в фільтруванні певних обсягів досліджуваної рідини (або твердої речовини, розведеного у воді) через мембранні фільтри №2 або №3, на яких затримуються бактерії. Фільтри переносять на чашки із середовищем Ендо, інкубіруемой при t ° 37 °, а потім досліджують виросли на поверхні фільтра темно-червоні з металевим блиском, рожеві і прозорі колонії. З колоній кожного типу готують мазки і фарбують їх по Граму. Колонії різних типів перевіряють на оксидазную активність, яка повинна бути негативною. Безбарвні і рожеві колонії додатково засівають на напіврідку середу з глюкозою і індикатором, на якій протягом 24-годинної інкубації при t ° 37 ° повинні утворюватися кислота і газ. Для визначення колі-індексу підраховують виросли на фільтрі колонії кишкової палички і потім проводять перерахунок на 1 л, 1 кг або 1 г в залежності від досліджуваного матеріалу. Коли-титр - найменшу кількість рідини або твердої речовини (виражене відповідно в мілілітрах або грамах), в якому виявляються кишкові палички. Коли-титр визначають бродильним методом, що полягає в посіві певних обсягів досліджуваного субстрату на середовища збагачення (глюкозопептонную або лактозопептонную з індикатором і поплавком і інші подібні середовища), які витримують t ° 37 °.
Великі обсяги засівають на концентровану середу, малі обсяги - в пробірки з середовищем нормальної концентрації. З усіх помутнілих пробірок незалежно від освіти кислоти і газу роблять висіву на середовище Ендо з подальшою ідентифікації колоній, що виросли. Орієнтовно за колі-титр приймають той найменший обсяг, при посіві якого на середовища збагачення виявлені кишкові палички. Найбільш ймовірне значення колі-титру води, молока, пива та ін. Визначають за допомогою спеціальних таблиць, зіставляючи з ними отримані результати. В цілому бродильний метод менш точний, ніж облік виросли бактерій на щільних середовищах і мембранних фільтрах. Коли-титр - величина, зворотна коли-індексу, який є прямим показником фекального забруднення. Можливий перерахунок коли-титру на колі-індекс і назад. Гранично допустимі величини колі-титру (колі-індексу) нормовані загальносоюзним стандартом або республіканськими технічними умовами, а також спеціальними інструкціями органів охорони здоров'я та інших відомств. Для отримання більш точних даних про наявність фекального забруднення об'єктів і його ступеня вважається за доцільне поряд з визначенням колі-титру (колі-індексу) проводити одночасний кількісний облік в досліджуваному матеріалі і інших санітарно-показових мікроорганізмів (наприклад, протея, ентерококів, спорових анаеробів, кишкових бактеріофагів). Див. Також Вода, Харчові продукти, Грунт.