Куріння призводить до виражених змін внутрішніх органів; найчастіше уражаються органи дихання, серцево-судинна система, шлунково-кишковий тракт. Від раку лёгкіхгібнет більше людей, ніж від будь-якого іншого виду раку. За сучасними даними вчених з США, близько 90% випадків раку легенів пов'язані з курінням в анамнезі. Курці хворіють на рак легенів в кілька разів частіше, ніж некурящі (основними етіологічними факторами вважаються радон, бензпірен і нітрозаміни, що містяться в тютюновій смолі. Нікотин не є канцерогеном.). Куріння також збільшує ймовірність і інших видів раку, зокрема раку піщеводаі раку порожнини рота.
До негативних наслідків куріння відносяться жовті зуби, неприємний запах з рота, неприємний запах від волосся, неприємний смак у роті вранці. За деякими даними, куріння підсилює алкогольне сп'яніння в півтора-два рази.
Незважаючи на величезний обсяг накопичених даних про шкоду куріння, існують і наукові роботи, що говорять про зворотне. Виразковий коліт спостерігається у некурящих людей в два рази частіше, ніж у тих, що палять. Нікотин тютюнового диму має протизапальні властивості. Є дані, що нікотин, в зв'язку зі своєю дією на баланс медіаторів ацетилхоліну і дофаміну в ЦНС, знижує ймовірність хвороб Паркінсона й Альцгеймера, проте, є і наукові роботи з діаметрально протилежними висновками. Є дані, що куріння знижує ризик розвитку раку ендометрія (в зв'язку з доведеним антиестрогенну дією нікотину), але ці дані також оскаржуються.
Деякі захворювання, найбільш характерні для тютюнопаління:
- У бронхах - хронічний бронхіт курця
- Слизова оболонка стравоходу стоншена, підвищено ранима
- У шлунку - хронічний гастрит курця або навіть виразка
- Слизова оболонка товстого кишечника теж змінена, порушена його моторика
- Дрібні артерії, артеріоли - підвищено збудливі, схильні до спазмів
- Засмучена робота потових і сальних залоз шкіри
- Волосся стоншені, січеться і випадає
- Знижується сексуальна потенція
- Оголюються шийки зубів, розвивається пародонтоз
Рак, він теж частіше розвивається там, де має місце хронічне запалення і дистрофія; саме тому у курців частіше буває рак, але не тільки рак бронхів, легенів, але також рак стравоходу, шлунка, товстого кишечника; у жінок - рак грудних залоз, матки та інших органів.