Муаммар Каддафі був одружений двічі. У 1969 році, майже відразу після приходу до влади, він одружився на колишній шкільній вчительці і дочки лівійського офіцера ФАТХ Нурі Халед.
Шлюб виявився недовгим. Однак саме в ньому народився його старший син Мухаммад.
Саїф аль-Іслам з'явився на світло в 1972 році. Він закінчив Університет аль-Фатех за фахом «архітектор та інженер», в подальшому навчався в міжнародній бізнес-школі IMADEC у Відні (Австрія) і в Лондонській школі економіки.
Третій син, Сааді Каддафі (1973 р.н.) - був полковником лівійської армії і професійним футболістом. Виступав за італійські клуби «Перуджа» і «Удінезе», а також очолював Лівійську футбольну федерацію.
Четвертий син - Ганнібал Муаммар Каддафі (англ.) (Нар. 1975) працював в General National Maritime Transport Company - державної лівійської компанії, що займається експортом нафти.
Крім рідних дітей, у Муаммара Каддафі були ще двоє прийомних: дочка Ханна, яка загинула в 1986 році, і рідний племінник мілад Абузтайя Каддафі. Вважається, що мілад врятував життя Муаммару Каддафі, коли американська авіація бомбардувала резиденцію лівійського лідера.