У матері Джонні, Бетті-Сью Уиллс Палмер Депп було кілька заміжжя. Джонні був останньою дитиною в її другому заміжжі за Джеком Джоном Деппом. Крім Джонні у неї було ще троє дітей. Старші - Деніел і Деббі від першого заміжжя, і єдинокровна сестра Джонні - Крісті.
Бетті-Сью працювала офіціанткою з 14-ти років. Джонні розповідає про свою матір: «Мати лаялася як моряк, грала в карти і курила». Перше, що пам'ятає Джонні, це білі скатертини на столиках закусочних, де він частенько чекав закінчення її робочого дня.
Батько, Джон Депп-старший, служив міським інженером. Сім'я часто переїжджала з місця на місце. Джонні розповідає в інтерв'ю, що він не може зрозуміти чому його батькам весь час не сиділося на місці. Навіщо були потрібні ці часті переїзди. Він гвооріт, що одного разу вони переїхали просто в сусідній будинок на тій же вулиці. Джонні не встигав завести собі друзів на новому місці, як сім'я знову зривалася і їхала в інше місто. Найчастіше Джонні доводилося спати в коробці, бо меблі було колись розставити.
«У той час, коли я був хлопчиком, мені довелося жити в різних місцях. Одного разу ми оселилися в Мірамар, у Флориді, жахливий період. Ми жили на 68-й Авеню, недалеко від будівлі Суду, на розі проїзної вулиці. Будинок був побудований в стилі 60-х років і мав три спальні. Я до сих пір пам'ятаю запах бобів і шинки на нашій кухні. Пам'ятаю, як мої брат і сестра, жартуючи, билися один з одним. У мене був пудель на прізвисько Пеппі. Спальню я ділив з братом, який старший за мене на 10 років. Він заслухувався музикою Вана Моррісона і Боба Ділана. Ми постійно пересувалися. Мама любила переїзди з кількох причин. На той час, як мені виповнилося 15 років, ми вже багато разів поміняли місця проживання. Нелегке було час. Залежно від того, наскільки швидко ми переїжджали з місця на місце, мені доводилося зустрічатися з багатьма людьми, у мене раз у раз з'являлися нові друзі. »
Його батьки розлучилися, коли Джонні було 15 років. Розлучення виявилося для підлітка найсильнішим ударом. Він розповідає, що пам'ятає, як в родині були постійні скандали, а діти вирішували хто з ким буде жити в разі розлучення батьків. Джонні, як найменша дитина, залишився з матір'ю. Він постарався взяти на себе опіку над нею, намагаючись замінити їй пішов батька.
Однак, в цьому ж віці, після розлучення батьків, Джонні практично йде з сім'ї і живе в машині його друга Села Дженко.
Трохи пізніше Джонні зробить тату з ім'ям матері на лівій руці. З батьком у Джонні відносини будуть натягнутими довгий час.
Батько Бетті-Сью був чистокровним індіанцем черокі. Джонні так згадує про своїх індіанських предків: «Я пам'ятаю нігті на ногах у моїй прабабусі. Не знаю, чому я запам'ятав саме їх, але вони закарбувалися в моїй свідомості назавжди. Вони були схожі на горіхи кеш'ю. Прабабуся померла приблизно в 102 року, я тоді був ще зовсім дитиною »
Інший його дідусь, Джим, ірландець за проісходженія, став справжнім другом для Джонні. «Він був чудовою моделлю. Він водив автобус днем і гнав самогон з кукурудзи вночі. Він був на кшталт Роберта Мітчума, модник. Він завжди говорив про речі так, як вони є. Він називав негра негром - і поссал б на того, кому це не подобається. Він був також з іншої епохи - я маю на увазі, з радикально іншої епохи, з такою, до якої належали деякі з тих, про які ми говорили, як Брандо або Хантер, і навіть Кіт Річардс в деякому сенсі, і в повній мірі Ален . Я дійсно вірю, що це були найкращі часи. Я дійсно вірю, що в певному сенсі, якщо ти народився в шістдесяті або типу того, то у тебе за все просять занадто високу ціну - ти розумієш, що я? Я завжди відчував, що я повинен був народитися в іншу епоху, в інший час »
Джим тепер виколотий у вигляді тату на руці Джонні
Сильний вплив на Джонні надав його дядько Орен Ларрі Депп, який служив проповідником в церкві. «Мій дядько був проповідником, і у нього при церкві була група, яка виконувала госпел. Він стояв під час служби на своєму подіумі, піднісши руки вгору, і вигукував: "Прийдіть і знайдіть порятунок!" І натовп падала ниць і була готова цілувати його ноги. Тоді я вперше побачив, як це - бути кумиром. Мої двоюрідні брати грали в церковній групі і виконували всякі християнські пісні. Саме тоді я вперше в житті побачив електрогітару, Бажання мати точно таку ж повністю захопило мене, так що мамі нічого не залишалося, як купити у моїх кузенів гітару за 25 доларів ».
