Знешкодити джерела інфекції при різних хворобах вдається з неоднаковою повнотою. Особливо важко нейтралізувати джерело інфекції, якщо хвороба в короткі терміни набуває широкого поширення. Наприклад, під час спалаху грипу велике число хворих виключає будь-яку можливість вичерпної ізоляції. Часткова ізоляція нерідко вимушено застосовується і при інших хворобах (кір, дизентерія і т.д.). Скільки-небудь повне знешкодження джерела інфекції в багатьох випадках важко особливостями клінічного перебігу хвороби і відсутністю доступних і ефективних способів її розпізнавання. При антропонозних хворобах повнота виявлення і знешкодження джерела інфекції залежать і від ставлення населення (пізнє звернення, відмова від госпіталізації, самостійне лікування антибіотиками і іншими препаратами і т.д.). Повноцінність знешкодження джерела інфекції багато в чому залежить від можливостей лікувальної медицини. При багатьох хворобах лікування поки займає тривалий час і не дозволяє у всіх випадках виключити носійство (дизентерія, черевний тиф, дифтерія тощо). Має також значення і характер джерела інфекції - людина або тварина, хвора або носій, а якщо тварина, то домашнє, синантропних або дике і т. Д. Все це настільки очевидно, що не потребує поясненні. Проте, знешкодження джерела інфекції є важливим заходом профілактики багатьох хвороб.
Шляхи знешкодження джерела інфекції різні. Дикі тварини та в першу чергу гризуни піддаються винищенню. У домашніх тварин поряд з забоєм можливі в ряді випадків ізоляція і лікування. Заражена людина (хворий, носій) як джерело інфекції знешкоджується шляхом ізоляції (роз'єднання), госпіталізації і лікування.
Ізоляція хворих, виявлених в поліклініці, здравпункте, дитячих та інших установах, на короткий термін (до моменту госпіталізації) проводиться шляхом приміщення хворого в ізолятор. При ряді хвороб (дизентерія, коліентеритів, сальмонельози, вітряна віспа та ін.) Застосовується ізоляція хворого в домашніх умовах. Для ізоляції носіїв при ряді хвороб використовується госпіталізація. Найчастіше носії з числа які відвідують дитячі заклади, а також працюють в харчових підприємствах і на спорудах водопостачання ізолюються в домашніх умовах. При хронічному носійстві в ряді випадків змінюють характер трудової діяльності (переклад на іншу роботу).
Госпіталізація хворого дає хороший ефект при гостро протікають хворобах (висипний тиф, поворотний тиф, чума, холера і т.д.). Значно складніше використовувати метод госпіталізації при затяжних і хронічно протікають хворобах, оскільки в таких випадках необхідна тривала госпіталізація.
Госпіталізація застосовується не тільки для виключення заражень від хворого, але і з метою збереження його здоров'я. Обов'язковій госпіталізації підлягають хворі на чуму, холеру, віспу, висипний і поворотний тифи, черевний тиф і паратифу, інфекційним гепатитом і деякими іншими хворобами. При чумі, холері, віспі поряд з госпіталізацією хворого ізолюються і спілкувалися з ним в ізоляторі, що знаходиться на території лікувального закладу. В останні роки, виходячи з принципу «де хворому краще», значно ширше, ніж раніше, при ряді хвороб (дизентерія, коліентеритів, сальмонельози та ін.) Застосовують лікування вдома. У разі залишення хворого в домашніх умовах вживають заходів для виключення зараження членів сім'ї (окрема посуд, дезінфекція виділень) і забезпечення постійного медичного спостереження. Хворого у встановлений час відвідують дільничний лікар і сестра. Після закінчення лікування проводиться лабораторне обстеження.
На ефективність госпіталізації як протиепідемічного заходу впливають багато факторів. Наприклад, абсолютно неприпустима перевезення хворого на громадському і випадковому транспорті. Для цієї мети можна використовувати тільки спеціально обладнаний транспорт, який після доставки хворого необхідно піддати дезінфекції.
З заходів, здійснюваних в лікувальному закладі, особливо потрібно виділити санітарну обробку хворого, приміщення хворого з неясним діагнозом і зі змішаною інфекцією в ізольовану палату або бокс.