Посадова особа, відповідальна за забезпечення безпечної експлуатації суден на внутрішніх водних шляхах, тепер є тією самою особою, що і передбачено в відповідність з Кодексом внутрішнього водного транспорту Російської Федерації (далі - КВВТ) в системі управління безпечною експлуатацією суден. Для морського транспорту така особа є призначеною особою відповідно до Міжнародного кодексу Управління безпекою (МКУБ).
Поправками уточнюється, що вимоги технічних регламентів є предметом перевірки при ліцензуванні тільки, якщо технічні регламенти застосовні до ліцензованих об'єктів (зокрема техрегламенти не застосовуються до об'єктів, випущеним в обіг на території Російський Федерації до вступу в силу відповідного технічного регламенту).
Відповідно до змін Кодексу торгового мореплавання (КТМ) і КВВТ уточнений перелік суднових та інших документів, які вимагаються від ліцензіата, а також введені вимоги про надання документів про страхування (або іншому фінансовому забезпеченні) цивільної відповідальності за заподіяння шкоди життю і здоров'ю човнів екіпажів суден і пасажирів (де це можливо).
Істотні спрощення введені для маломірних суден, що використовуються в усіх ліцензованих видах діяльності. Тепер для отримання ліцензії при використанні маломірного судна достатньо пред'явити в орган, крім документів, передбачених законодавством про ліцензування окремих видів діяльності, заяву, судновий квиток (в якому вказуються види діяльності маломірного судна), документи про страхування (або іншому фінансовому забезпеченні) цивільної відповідальності за заподіяння шкоди життю і здоров'ю човнів екіпажів суден і пасажирів (для перевезення пасажирів), документи судноводіїв маломірних суден для членів ек пажів, допущених до управління маломірним судном.
Заява про надання ліцензії та додані до нього документи здобувач ліцензії має право направити в орган у формі електронних документів, підписаних посиленою кваліфікованої електронним підписом претендента ліцензії.
Положенням про ліцензування не передбачено відвідування з метою перевірки заявленого для ліцензування судна інспекторами ліцензує органу. Ліцензійна перевірка може бути проведена у вигляді документарної перевірки.