Здійснення ринкових реформ викликало зміни в митній політиці, сутність якої, як органічною складовою частини внутрішньої і зовнішньої політики держави, виражається у виробленні єдиної системи узгоджених економічних, політичних, організаційних заходів з розвитку зовнішньоекономічних зв'язків країни. Реалізація цілей митної політики призводить до змін у характері діяльності митних структур, підвищенню їх ролі в здійсненні державного регулювання зовнішньоекономічної діяльності.
Здійснення нової митної політики країни зажадало створення досить складної, розгалуженої, багаторівневої системи виконавчих органів, здатних одночасно розробляти стратегію розвитку митної справи та безпосередньо втілювати в життя механізми митно-правового регулиро-вання зовнішньоекономічних зв'язків, захищати економічні інтереси і безпеку країни.
Система митних органів покликана забезпечити високий рівень керованості митними органами, відповідати структурі і характеру зовнішньоекономічної діяльності та мати механізми адаптації до зовнішніх умов. [1]
Найважливішим завданням організації митної справи є вибір оптимальної системи митних органів, а також визначення ефективних і раціональних форм і методів їх діяльності та взаємодії з іншими державними органами.
Говорячи про систему державних органів можна умовно виділити дві групи факторів, умов і підстав, які обумовлюють можливість розгляду сукупності зазначених органів як певної системи органів і структур, що відрізняється специфічними рисами і властивостями, притаманними як в цілому системам (підсистем) органів законодавчої влади; органів виконавчої влади; органів судової влади, так і системі митних органів, оскільки саме вона знаходяться в центрі нашого наукового дослідження.
Термін «система» означає ціле, складене з частин; з'єднання, сукупність елементів, що знаходяться у відносинах і зв'язках один з одним, яка утворює певну цілісність, єдність [2].
При визначенні поняття системи необхідно враховувати найтісніший взаємозв'язок його з поняттями цілісності, структури, зв'язку, елемента, відносини, підсистеми та ін. Кожна система характеризується не тільки наявністю зв'язків і відносин між утворюють її елементами, але нерозривним єдністю з навколишнім середовищем, у взаємодії, з якої система проявляє свою цілісність. Ієрархічність, багаторівневість, структурність - властивості не тільки будови системи, але і її поведінки: окремі рівні системи обумовлюють певні аспекти її поведінки, функціонування; цілісне функціонування виявляється результатом взаємодії всіх її сторін і рівнів.
Системи слід розмежовувати на статичні і динамічні системи. Систему митних органів, розглядаючи з цієї позиції, безсумнівно, необхідно віднести до динамічної системі.