До органів федеральної служби безпеки відносяться:
федеральний орган виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки;
управління (відділи) федерального органу виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки по окремих регіонах і суб'єктах Російської Федерації (територіальні органи безпеки);
управління (відділи) федерального органу виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки в Збройних Силах Російської Федерації, інших військах і військових формуваннях, а також в їх органах управління (органи безпеки у військах);
управління (відділи, служби, загони) федерального органу виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки по прикордонній службі (прикордонні органи);
інші управління (відділи) федерального органу виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки, які здійснюють окремі повноваження даного органу або забезпечують діяльність органів федеральної служби безпеки (інші органи безпеки);
авіаційні підрозділи, центри спеціальної підготовки, підрозділи спеціального призначення, підприємства, освітні і наукові організації, експертні, судово-експертні, військово-медичні підрозділи і організації (далі - військово-медичні організації), військово-будівельні підрозділи і інші організації і підрозділи, призначені для забезпечення діяльності федеральної служби безпеки.
Територіальні органи безпеки, органи безпеки у військах, прикордонні органи та інші органи безпеки є територіальними органами федерального органу виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки та перебувають у його прямому підпорядкуванні.
Федеральний орган виконавчої влади в галузі забезпечення безпеки, територіальні органи безпеки, органи безпеки у військах і прикордонні органи можуть мати в своєму складі підрозділи, безпосередньо реалізують основні напрямки діяльності органів федеральної служби безпеки, управлінські та забезпечити функції.
Створення органів федеральної служби безпеки, не передбачених цим Законом, не допускається.
В органах федеральної служби безпеки забороняються створення структурних підрозділів політичних партій і діяльність політичних партій, громадських рухів, які мають політичну мету, а також ведення політичної агітації і передвиборних кампаній.