Синдром Ретта - X-зчеплене домінантне захворювання, викликане делецией локусу Xq28 або мутаціями гена МЕСР2, лежачого в даному локусі. Ген МЕСР2 складається з 4 екзонів і кодує метил-СрG-зв'язуючий білок 2. Мутації в цьому гені відповідають за 90-95% випадків розвитку класичного синдрому Ретта і 40-60% випадків атипових форм синдрому Ретта. Білок MeCP2 належить до сімейства метил-зв'язуючих протеїнів. Він зв'язується зі специфічними генами-мішенями швидко розвивається мозку і регулює їх експерсс, впливаючи, таким чином, на розвиток нервової тканини. У гені описано близько 800 мутацій, більшість з яких є нуклеотидними замінами і локалізовані в екзонах 3 і 4. Дев'ять точкових мутацій є найбільш частими (R168X, R270X, R255X, T158M, R306C, R294X, R133C, R106W, L386fs), частка яких становить 60-70%, близько 10% мутацій - це невеликі делеції (20-150 н.п.) в карбокси-термінальному сегменті гена МЕСР2, великі перестроювання, захоплюючі цілі екзони або навіть ген складають від 7,5% в атипових випадках до 37 % при класичній формі.
Частота захворювання 1: 10000 - 1: 15000. Випадки синдрому Ретта, як правило, носять спорадичний характер, представляючи собою мутації de novo, однак описані і сімейні випадки (при гонадного мозаїцизм у одного з батьків). Дане захворювання є другою за частотою після синдрому Дауна причиною важкої розумової відсталості у дівчаток. Для плодів гемізіготних по Х-хромосомі мутації в гені МЕСР2 є летальними. Тому у чоловіків синдром Ретта практично не зустрічається, за винятком випадків синдрому Кляйнфельтера і соматичного мозаїцизм.
Крім класичного синдрому Ретта, існують атипові форми: варіант Заспівала (variant Zapella) зі збереженою промовою, форма з пізнім початком регресу, Х-зчеплена синдромально розумова відсталість у хлопчиків (тип Лубу), важка вроджена енцефалопатія у хлопчиків і ін. Мутації в гені МЕСР2 виявляють при деяких синдромах, що характеризуються затримкою розумового розвитку, таких як Ангельмана-подібний синдром, синдром, схожий з синдромом ламкої Х-хромосоми, фенотип схожі з аутизмом. За розвиток деяких атипових форм, таких як, рання епілептична енцефалопатія 2, вроджена форма синдрому Ретта, відповідають інші гени (CDKL5, FOXG1).
У Центрі Молекулярної Генетики методом кількісної MLPA проводиться пошук делеции / дуплікації локусу Xq28 і пряме автоматичне секвенування гена МЕСР2.