Урочище Перинь названо так на ім'я бога Перуна - прародителя всіх родів російських, бога-громовержця. Тут до хрещення Русі знаходилося слов'янське капище. Велична і мальовниче місце було найкращим для язичницьких обрядів. Після прийняття християнства центр слов'янської релігії знищили. На його місці зрубали з дерева церква Різдва Богородиці. Може тоді був створений при ній Перинскій Різдва Богородиці чоловічий монастир. Літописи про це мовчать.
Знаходиться він на півострові, де річка Волхов випливає з озера Ильменского, в шести кілометрах від Новгорода на південь. З боку Юр'ївської слобідки його закриває висаджена сосновий гай.
Перша згадка про нього зустрічається під 1386 роком. Тоді при підході військ князя московського Дмитра Донського жителі Новгорода його спалили разом з іншими монастирями. Також відомо, що 1528 року там побудована трапезна з дерева з церквою Трійці. Вона стала другим побудованим на острові храмі (в той час півострів був ще островом). Коли шведи окупували територію Новгородську, обитель була сильно розкрадена і віддана вогню. Це датується 1611 -1617 роками. Спорожнілий скит для підтримки і відновлення в 1634 році прикріплений до Свято-Юр'євській монастирю за указом царя. Тільки в 1828 році церковна будівля відремонтували, освятили і при церкви знову заснували скит.
За постановою радянської влади в 1919 році Перинскій скит і інші монастирі землі новгородської були розпущені і закриті. Обитель поступово розорили. Розібрали огорожу, дзвіницю з шістьма дзвонами, господарські будівлі на цеглу та інші частини. Риболовецька артіль використовувала все для побудови сховища льоду. А будівля церкви перетворили на склад.
У воєнний період скит потрапив на зайняту німцями територію. Після закінчення війни тут запрацювала філія рибного комбінату. Потім вакантне місце зайняла туристична база. Тільки в кінці 20-го століття Перинскій півострів був відданий назад Православної Церкви. Зараз скит відноситься до Свято-Юр'єву монастирю.
Пам'ятка скиту - мініатюрна витончена Церква Різдва Богородиці. Вона здається дуже легкою, спрямованою вгору і високою, хоча її висота всього 12 метрів. Це досягається трохи звуженими догори стінами, барабаном, віконцями, лопатками. Вона є однією з найменших храмів новгородської землі. Точного датування її побудови немає, імовірно в 1226 році. Сьогодні вона відреставрована і має первинний вигляд.