Лікування за допомогою аллотрансплантации кишечника може застосовуватися в разі відсутності тонкого кишечника. Видалення кишечника виробляють при його вогнепальне поранення, тромбоз судин кишечника, кишкової фазі гострої променевої хвороби і завороту кишок. Серед хронічних уражень кишечника, що вимагають тотальної заміни органу, слід назвати дисемінований поліпоз (хвороба Гарднера), хронічний ентероколіт (хвороба Крона та ін.), Хвороба невсасиванія. Показанням до пересадки кишечника може служити також і вроджене укорочення його. Хворий, як правило, вмирає від прогресуючого голодування. Для збереження життя пацієнта необхідно 60 - 90 см тонкого кишечника. Донорами можуть бути живі здорові люди, т. К. Видалення одного - двох метрів тонкого кишечника помітно не позначиться на здоров'ї донора. З цією метою можна залучати родичів реципієнта. Використання трупного органу в даному випадку не завжди можливо, т. К. Після смерті кишечник дуже швидко приходить в непридатність в результаті аутолізу (самопереваріванія). З хірургічних позицій пересадка кишечника складна, оскільки доводиться зшивати дуже багато тонких вен, що може привести до тромбозу і порушення кровообігу в частині кишечника. Попередні досліди Престона і Ліллехая (США) показали, що пересадка тонкого кишечника має реальні перспективи.
У 1902 р A.Carrel зробив серію алогенних пересадок всієї тонкої кишки, при яких він застосував свій знаменитий судинний шов. Однак досвід в цілому не увінчався успіхом. У 40-ті роки В.П. Деміхов також зробив спроби ауто- і аллоогенной трансплантації худої і клубової кишки, але термін життя собаки після цієї операції був досить обмеженим. Лише в кінці 50-х років знову було піднято питання про трансплантацію кишечника, але вже на іншому рівні завдяки успіхам хірургії і біологічних наук. Були розроблені найрізноманітніші варіанти і моделі пересадки кишечника і його частин. Серед них сегментарная аутотрансплантация тонкої кишки на шию, наприклад, знайшла шлях до клініки і в даний час застосовується досить широко для заміщення шийного відділу стравоходу. Інші ж моделі, зокрема трансплантація великих ділянок тонкої і товстої кишки, поки не дали прийнятного клінічного ефекту.
Принципово розрізняють дві моделі пересадки тонкої кишки: трансплантація на судинній ніжці з відновленням кровотоку трансплантата хірургічними методами і вільна трансплантація без відновлення кровопостачання трансплантата (імплантація).
Історично перші трансплантації тонкої кишки на судинній ніжці були, ймовірно, ортотопіческого - сегментарними і тотальними. Перші науково розроблені моделі пересадки тонкої кишки з'явилися в кінці 50-х - початку 60-х років. Вони довго служили основою для постановки експериментів з пересадки тонкої кишки за кордоном і впливали на розвиток вітчизняних досліджень.
Паралельно для дослідження проблеми гістогенезу, онкогенеза, регенерації та адаптації на тканинному і клітинному рівні застосовувалася імплантація кишкової тканини фетального походження.
Імплантацію кишкової тканини онкологи почали застосовувати ще в 40-і роки для дослідження питань онкології і ембріології. Прямий інтерес до особливостей приживлення кишкових клаптів, імплантованих в різні області тіла, виник лише в 70-і роки.
Слід зазначити, що до цих пір не вдалося отримати приживлення в організмі імплантатів кишки дорослих особин без хірургічного відновлення кровопостачання пересадженого клаптя, навіть при аутогенним пересадці. Тому всі існуючі імплантації тонкої кишки реалізовані з матеріалом, узятим від плодів другої половини вагітності і як виняток від новонароджених.
Місцем імплантації служили найрізноманітніші органи і області тіла: передня камера ока, яєчко, капсула нирки, підшкірна жирова клітковина спини та інших областей тіла, вільна черевна порожнина і сальник.
Пересадка товстої кишки значно менше розроблена, ніж трансплантація тонкої кишки. При цьому створюються моделі пересадки органу або його окремих частин на судинній ніжці, вивчаються особливості розвитку імплантатів товстої кишки плодів. Трансплантація товстої кишки на судинній ніжці проводиться для заміщення не тільки самої товстої кишки, а й інших органів (стравохід, органи таза). Імплантація фетальних тканин служить більше для онкологічних цілей, а також для дослідження патогенезу специфічних для товстої кишки захворювань.
Проблеми, пов'язані з трансплантацією товстої кишки, мають багато спільного з тими, які зустрічаються при пересадці тонкої кишки. Це стосується і моделей операції, і післяопераційних ускладнень, і проблем відторгнення алотрансплантату, боротьби за продовження їхнього життя і функціональної здатності.
Порівняння існуючих моделей пересадки тонкої і товстої кишки на судинній ніжці дозволяє зробити наступний висновок. Кожен вид операції має свої переваги і недоліки, може бути використаний в досвіді для виконання певних завдань. На моделях імплантації тонкої і товстої кишки плодів, а також пухлин, що розвиваються з цих органів, були отримані нові дані на стику трансплантології, онкології, алергології та імунології. Запропоновано перспективний метод профілактики спонтанного і перевівного раку товстої кишки шляхом попередньої підсадки фетальної тканини органу мішені.