Інфекційні захворювання майбутньої матері можуть вкрай негативно позначитися на здоров'ї дитини. До них відносяться активні форми первинної туберкульозної інфекції. Основним показанням до переривання вагітності в першому триместрі (до 12 тижнів) є поширений деструктивний процес у легенях жінки, що не піддається лікуванню, якщо він мав місце і загострювався протягом попередньої вагітності.
Серйозну небезпеку під час вагітності представляють також важкі форми вірусних гепатитів. При цьому захворюванні випадки смерті у вагітних жінок в три рази вище, ніж у невагітних. Особливо небезпечно інфікування в останньому триместрі вагітності, коли ризик загибелі матері зростає багаторазово. При хронічній формі вірусного гепатиту настання вагітності, як правило, не погіршує загального стану жінки. Однак високий ризик зараження плода, причому до цих пір не доведено, що кесарів розтин дозволяє уникнути інфікування дитини вірусним гепатитом.
Інший страшний ворог вагітної жінки - краснуха. Це інфекційне захворювання, що протікає практично непомітно у дітей. здатне привести до мимовільного аборту або стати причиною серйозних вад розвитку плоду (мікроцефалія, менінгіт, катаракта). У випадках, коли жінка не хворіла на краснуху в дитинстві, їй необхідно зробити щеплення і оберігатися протягом півроку після неї.
До неінфекційних захворювань, які становлять серйозну небезпеку для вагітної жінки ставляться: важкі захворювання ендокринної системи (в тому числі, цукровий діабет), важкий порок серця і гіпертонічна хвороба з порушеннями системи кровообігу, цироз печінки; серйозні захворювання легенів з дихальною недостатністю, хвороби нирок, що ведуть до хронічної ниркової недостатності (гломерулонефрит); системні захворювання сполучної тканини (червоний вовчак), важкі психічні захворювання і епілепсія.
Будь-які онкологічні захворювання є протипоказанням для вагітності. так як при них можливе збільшення зростання новоутворень. Разом з тим, при лікування, розпочатого після 12 тижня, імовірна позитивна динаміка. При доброякісних пухлинах, таких як міома матки, питання про збереження вагітності лікар вирішує індивідуально.