Хоча острів Гуам був краще обладнаний, американське командування і особисто адмірал Честер Німіц вибрали в якості бази, з якої повинні були вилетіти Б-29 з атомним вантажем, розташований також в Маріанської гряді острів Тініан. Цей острів розташований на 150 км ближче до Японії, ніж Гуам, він мав ідеально рівну коралову майданчик для використання в якості злітно-посадкової смуги і був зручний для посадок великих бомбардувальників з моря.
У момент вибуху американський президент перебував на борту крейсера «Аугуста», повертаючись в США з Потсдамської конференції. Отримавши повідомлення про руйнування атомною бомбою Хіросіми, Трумен сказав принести шампанське і урочисто промовив: «Джентльмени, тільки що ми скинули на Японію бомбу, яка за своєю потужністю дорівнює 20 тис. Т тринітротолуолу ... Ця бомба називається атомної». Звертаючись до державного секретаря Бирнса він заявив, що атомне бомбардування стала «найбільшою подією в історії людства». Про атомне бомбардування Хіросіми американський народ дізнався по радіо. Диктор оголосив заяву президента США Трумена, в якому говорилося:
«16 годин тому американський літак скинув на важливу японську військову базу Хіросіма (о. Хонсю) бомбу, яка має більшу руйнівну силу, ніж 20 тис. Т вибухових речовин. Ця бомба володіє руйнівною силою, в 2 тис. Разів перевершує руйнівну силу англійської бомби «Гренд Слоем», яка є найбільшою бомбою, коли-небудь використаної в історії війни. До 1939 р вчені вважали теоретично можливим використовувати атомну енергію. Але ніхто не знав практичного методу здійснення цього. До 1942 р проте, ми дізналися, що німці гарячково працюють в пошуках способу використання атомної енергії на додаток до інших знарядь війни, за допомогою яких вони сподівалися закабалити весь світ. Але вони не досягли успіху ».
Однак американці були збентежені. Всупереч їх очікуванням Японія не капітулювала після знищення Хіросіми і його жителів. Японське уряд приховав від народу повідомлення про застосування США принципово нового, що володіє величезною руйнівною силою атомної зброї і продовжувало готувати населення до вирішального бою на своїй території «до останнього японця». Питання про бомбардування Хіросіми ні навіть обговорено на засіданні Вищої ради у керівництві війною. Незважаючи на загибель в атомному вогні безлічі співвітчизників, і можливість повторної бомбардування з застосуванням нової зброї, прихильники «партії війни» готували жінок, старих і дітей до боротьби з ворогом із застосуванням бамбукових копій, а в горах створювалися бази партизанської війни. В околицях міста Мацусіро в префектурі Нагано (центральна Японія) тривало інтенсивне будівництво з використанням рабської праці корейців для монарха і вищого командування величезного бункера на період вирішального бою. У видовбаному в скельній породі притулок повинні були розташовуватися імператорська сім'я з обслуговуючим персоналом, генеральний штаб, служби зв'язку.
Не розуміючи всю складність створення атомної зброї, вищі чини армії і флоту вимагали від вчених негайного виготовлення «зброї відплати» - японської атомної бомби. Роботи над її створенням були зашифровані як «проект Ні», з читання першого ієрогліфа прізвища керівника проекту, учня Нільса Бора, професора Есио Нісина.
До останнього існували надії на використання зберегла свою боєздатність численної Квантунської армії, розташованої в Північно-Східному Китаї (Маньчжурія). З іншого боку, розглядався варіант, у разі висадки американських військ на Японські острови, переправити імператора і його сім'ю в маріонеткову державу Маньчжоу-Го. При цьому вважалося, що американці не будуть піддавати атомному бомбардуванню територію союзної Китаю.
Не виключалося і масове застосування у відповідь на атомних ударів накопиченого в величезних кількостях в Квантунської армії забороненого бактеріологічного і хімічного зброї. За визнанням службовців японського центру з розробки бактеріологічної зброї «загін №731», в кінці війни готових до вживання хвороботворних бактерій зберігалося стільки, що «якби вони при ідеальних умовах були розсіяні по земній кулі, цього вистачило б для знищення всього людства».
Спочатку другий атомному бомбардуванню мав пройти крізь розташований на острові Кюсю місто Кокура, але через погану видимість, вже перебуваючи над метою, екіпаж американського бомбардувальника прийняв рішення атакувати Нагасакі, де можна було скинути бомбу, візуально наводячи літак на об'єкт поразки, не покладаючись на недосконалий наводить радар.
Картина після вибуху була жахлива: «Більш ніж за півтора кілометра від епіцентру вибуху вздовж дороги лежали загиблі з численними опіками та ранами на тілах ... Трупний запах розкладання проникав в ніздрі рятувальників, яких постійно нудило ... На третій день після вибуху бомби почали відбуватися дивні речі: врятувалися стали вмирати в величезних кількостях ... Лікарі не могли пояснити дану загадку. І в Нагасакі, і в Хіросімі через вже тиждень після атомних бомбардувань пацієнти приходили в лікарні і вмирали, не доходячи до кабінетів лікарів ... Потерпілі не були жертвами звичайної бомби, вони були опромінені гамма-променями, що зруйнували їх нутрощі, і, як бомба з годинниковим механізмом, які поставили на них страшну друк смерті ».
В опозиції прихильникам негайного закінчення війни знаходилося командування імператорської армії, яке, боячись відповідальності за скоєні злочини, які не погоджувалися з умовами Потсдамської декларації. Перш за все, з вимогою про покарання японських військових злочинців. Їх позиція зводилася до того, щоб домовитися про капітуляцію Японії чотирма умовами, а саме збереження існуючого державного ладу, покарання військових злочинців самими японцями, самостійне роззброєння, недопущення окупації Японії союзниками, а якщо окупація неминуча, то вона повинна бути нетривалої, здійснюватися невеликими силами, не зачіпаючи столицю - Токіо.
Його підтримував начальник генерального штабу армії Умедзу, який переконував присутніх на засіданні: «Проведена підготовка до вирішального бою на території власне Японії. Хоча вступ Радянського Союзу під час війни створило для нас невигідну обстановку, все ж не слід відмовлятися від доброї нагоди для нанесення останнього удару по Сполученим Штатам і Англії. Душі наших полеглих героїв не пробачать нам беззастережну капітуляцію. Як мінімум повинні бути висунуті чотири умови ».
При голосуванні пропозиції міністра закордонних справ Того про прийняття Потсдамської декларації лише за однієї умови - збереження в Японії імператорської системи правління - військовий міністр Анами виступив проти нього. Його підтримали військово-морський міністр, міністри юстиції, озброєння, сільського господарства і торгівлі, транспорту і зв'язку, освіти і міністр без портфеля. Решта п'ять членів кабінету утрималися. Оскільки за пропозицію Того проголосували лише шість міністрів, остаточне рішення не було прийнято.
«1. Ставка має намір як і раніше вести основні військові дії проти Сполучених Штатів і одночасно повсюдно розгорнути дії з метою подальшого розгрому Радянського Союзу, щоб зберегти державний лад і захистити землю Імператора.
2. Командувачеві Квантунської армією зосередити основні зусилля проти Радянського Союзу, розбити супротивника і захистити Корею ». Свої дії військові прикривали закликами ціною загибелі народу «захистити божественного мікадо, не допустити ворога на священну землю Ямато».
При вирішенні питання про імператора Японії у Вашингтоні не могли не враховувати позиції урядів і народів союзних держав. Посол Японії в Швеції С. Окамото попередив Токіо: «У американців виникли труднощі у відносинах з союзниками через питання про статус імператора. Росія і Китай наполягають на його усунення. Великобританія згодна з тимчасовим статусом імператора, лондонська «Таймс» висловлюється проти збереження імперії ».
Остаточна форма правління Японією відповідно до Потсдамської декларацією буде встановлена вільним волевиявленням японського народу. Збройні сили союзних держав будуть перебувати на території Японії до остаточного виконання четвертого пункту Потсдамської декларації ». У ноті Бирнса містилося звернення до імператора Хірохіто віддати наказ усім збройним силам як всередині країни, так і за кордоном, «припинити бойові операції і скласти зброю».
Для того щоб «пом'якшити» тон ноти, на вимогу представників армії і уряду, чиновники японського МЗС замінили словосполучення «будуть підпорядковані», давши більш вільний переклад - «будуть обмежені». Однак це вже нічого не змінювало і було лише спробою хоч якось «врятувати обличчя».
Не вдався і затіяний виступали проти прийняття умов Потсдамської декларації військовими з міністерства сухопутних сил заколот. Їх план викрасти грамофонну пластинку, на якій імператор записав свій рескрипт про припинення війни, провалився.
У рескрипті японський монарх, без тіні самокритики про особисту відповідальність закликав підданих продовжувати вірити в священну країну Ямато: «Піклуючись про безпеку і цілісності державного устрою Імперії, Ми вічно перебуваємо з вами, Наші віддані піддані, і покладаємося на вашу неколебимую віру і безумовну щирість. Утримайтеся від прояву емоцій, які можуть привести до непотрібних ускладнень, докладете всіх зусиль для того, щоб уникнути братовбивчих чвар. Нехай нація як єдина родина триває з покоління в покоління, нехай вона вірить в непорушність нашої священної землі, пам'ятає про своє високе призначення і довгій дорозі, по якій їй доведеться йти в майбутнє ».
